More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3708 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3708  putative glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  100 
 
 
463 aa  963    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3593  putative glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  66.13 
 
 
436 aa  607  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.266826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2366  aminotransferase class-III  49.16 
 
 
438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552116  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0569  aminotransferase class-III  40.9 
 
 
435 aa  333  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.110238 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6410  aminotransferase class-III  40.98 
 
 
444 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3749  aminotransferase class-III  36.9 
 
 
445 aa  268  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0624  aminotransferase class-III  36.16 
 
 
448 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0291  aminotransferase class-III  36.73 
 
 
460 aa  256  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000819224  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1789  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.78 
 
 
426 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507749  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1413  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.8 
 
 
430 aa  247  4e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.190145 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1126  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.46 
 
 
429 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3180  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.58 
 
 
422 aa  239  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0266  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.41 
 
 
427 aa  239  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.08 
 
 
428 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0133  aminotransferase class-III  34.11 
 
 
431 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1464  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.63 
 
 
424 aa  239  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2421  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.83 
 
 
422 aa  238  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486284 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2502  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.74 
 
 
425 aa  237  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2065  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.25 
 
 
438 aa  237  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870118  normal  0.0113612 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0285  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.78 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4475  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.39 
 
 
428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0216  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.35 
 
 
417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000686637  normal  0.0344059 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0185  aminotransferase class-III  37.77 
 
 
448 aa  234  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.04 
 
 
428 aa  234  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2411  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.66 
 
 
433 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921175  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2361  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.66 
 
 
433 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1725  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.8 
 
 
428 aa  233  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1759  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.8 
 
 
428 aa  233  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0337  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.48 
 
 
427 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00652219  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1208  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.41 
 
 
432 aa  232  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1717  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.97 
 
 
441 aa  232  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.189585 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3547  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.95 
 
 
425 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.573443  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1227  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.62 
 
 
422 aa  231  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000806301  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2675  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.78 
 
 
432 aa  230  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0113  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.64 
 
 
435 aa  229  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4345  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.48 
 
 
432 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0417  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.42 
 
 
426 aa  229  5e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.237039  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0193  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.99 
 
 
431 aa  229  6e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1975  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  35.98 
 
 
439 aa  229  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102395  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2085  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.64 
 
 
435 aa  229  7e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1231  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.82 
 
 
427 aa  229  8e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.250088  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04841  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.53 
 
 
432 aa  229  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00934887  normal  0.931792 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2017  aminotransferase class-III  36.8 
 
 
424 aa  229  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.2 
 
 
428 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2625  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.8 
 
 
429 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4920  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.44 
 
 
432 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1373  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.09 
 
 
427 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1024  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.85 
 
 
434 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05401  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.32 
 
 
428 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.198771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00650  Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.09 
 
 
426 aa  227  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0667  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.34 
 
 
430 aa  228  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139196  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0218  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.59 
 
 
423 aa  228  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1816  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.06 
 
 
432 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.24 
 
 
427 aa  227  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2622  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.79 
 
 
445 aa  227  4e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  33.58 
 
 
437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11660  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  36.56 
 
 
429 aa  226  5.0000000000000005e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.545154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  36.97 
 
 
457 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0610  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.89 
 
 
433 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.36 
 
 
426 aa  226  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.956002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.99 
 
 
427 aa  226  7e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000584172  hitchhiker  0.00810852 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1162  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.52 
 
 
418 aa  225  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.467578  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.17 
 
 
427 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.456141  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0914  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.99 
 
 
446 aa  225  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.155106  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2666  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.43 
 
 
428 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0598472  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.14 
 
 
428 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1492  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.69 
 
 
429 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1914  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.65 
 
 
428 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1968  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.6 
 
 
431 aa  224  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1432  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.77 
 
 
428 aa  225  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2800  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.91 
 
 
431 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.279066  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1970  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.34 
 
 
444 aa  224  3e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.463267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4552  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35 
 
 
429 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0655  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.74 
 
 
428 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1608  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  37.36 
 
 
433 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.09 
 
 
431 aa  224  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0202  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.42 
 
 
431 aa  224  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.518998  normal  0.0385329 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4579  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.74 
 
 
429 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0442  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.83 
 
 
434 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0558  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.72 
 
 
433 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.655288 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4358  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.74 
 
 
429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4194  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.74 
 
 
429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4205  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.74 
 
 
429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4693  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.74 
 
 
429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4548  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.74 
 
 
429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3774  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.06 
 
 
429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0848252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4597  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.74 
 
 
429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0659  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.66 
 
 
428 aa  223  7e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.59993 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3177  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.74 
 
 
429 aa  223  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4245  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.25 
 
 
427 aa  223  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000211848  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0865  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  36.36 
 
 
425 aa  223  8e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.281516  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0645  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.28 
 
 
453 aa  222  9e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0514  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.56 
 
 
434 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0101623 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1340  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  36.18 
 
 
432 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0499  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.56 
 
 
434 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0531  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.56 
 
 
434 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0536  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.56 
 
 
432 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1468  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.91 
 
 
427 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.311379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4790  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.56 
 
 
434 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.302308  normal  0.0249328 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4306  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.47 
 
 
429 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>