30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2749 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2749  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 345 aa  709    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.589565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1889  aminoglycoside phosphotransferase  51.41 
 
 		 349 aa  354  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  47.21 
 
 		 353 aa  285  9e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1738  aminoglycoside phosphotransferase  44.05 
 
 		 379 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1663  aminoglycoside phosphotransferase  35.03 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2481  aminoglycoside phosphotransferase  36.22 
 
 		 382 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.469146  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2712  hypothetical protein  33.33 
 
 		 379 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1454  aminoglycoside phosphotransferase  36.88 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.599627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2318  aminoglycoside phosphotransferase  35 
 
 		 356 aa  172  9e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1797  aminoglycoside phosphotransferase  34.78 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1844  aminoglycoside phosphotransferase  35.88 
 
 		 392 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.812957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1529  hypothetical protein  36.56 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2377  aminoglycoside phosphotransferase  43.81 
 
 		 434 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  normal  0.630893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2307  aminoglycoside phosphotransferase  43.3 
 
 		 409 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2497  aminoglycoside phosphotransferase  42.78 
 
 		 434 aa  149  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.403294  hitchhiker  0.00457096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1805  aminoglycoside phosphotransferase  43.94 
 
 		 389 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  24 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  23.72 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  23.37 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3408  aminoglycoside phosphotransferase-like  37.33 
 
 		 263 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  19.61 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  19.32 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  21 
 
 		 522 aa  47.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  21.43 
 
 		 266 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  19.2 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  39.68 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1409  aminoglycoside phosphotransferase  24.26 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  20.71 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  28.3 
 
 		 244 aa  43.9  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>