51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2150 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  100 
 
 		 669 aa  1372    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  42.1 
 
 		 669 aa  498  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  41.53 
 
 		 668 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  41.53 
 
 		 668 aa  482  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  39.21 
 
 		 674 aa  465  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  39.82 
 
 		 668 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  39.62 
 
 		 668 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  36.28 
 
 		 669 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  38.3 
 
 		 662 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  37.65 
 
 		 662 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  38.53 
 
 		 667 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  37.94 
 
 		 667 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  37.21 
 
 		 667 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  35.06 
 
 		 703 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  36.39 
 
 		 699 aa  392  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  34.87 
 
 		 699 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  36.29 
 
 		 693 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  35.91 
 
 		 672 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  34.28 
 
 		 695 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  33.62 
 
 		 695 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  33.48 
 
 		 695 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  33.48 
 
 		 695 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  33.48 
 
 		 695 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  34.89 
 
 		 698 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  34.8 
 
 		 695 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  34.52 
 
 		 695 aa  353  7e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  34.52 
 
 		 695 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  33.14 
 
 		 697 aa  350  5e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  33.19 
 
 		 672 aa  349  8e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  32.96 
 
 		 704 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  30.35 
 
 		 706 aa  250  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  28.73 
 
 		 711 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  27.34 
 
 		 703 aa  219  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  27.44 
 
 		 712 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  27.3 
 
 		 712 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  26.82 
 
 		 716 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  26.7 
 
 		 716 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  25.98 
 
 		 716 aa  210  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  26.68 
 
 		 716 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  27.02 
 
 		 712 aa  207  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  26.91 
 
 		 656 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  26.41 
 
 		 712 aa  195  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  26.31 
 
 		 698 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  26.26 
 
 		 660 aa  148  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  27 
 
 		 573 aa  148  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  24.41 
 
 		 565 aa  126  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  24.42 
 
 		 706 aa  72.4  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  21.14 
 
 		 772 aa  70.9  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  22.02 
 
 		 835 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  21.99 
 
 		 807 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  21.31 
 
 		 681 aa  65.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>