47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0360 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  78.88 
 
 		 573 aa  943    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  100 
 
 		 565 aa  1159    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  30.16 
 
 		 669 aa  226  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  28.81 
 
 		 668 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  28.61 
 
 		 668 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  27.91 
 
 		 668 aa  212  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  27.8 
 
 		 669 aa  210  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  28.87 
 
 		 672 aa  210  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  27.45 
 
 		 668 aa  206  8e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  28.23 
 
 		 674 aa  201  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  27.99 
 
 		 662 aa  194  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  28.04 
 
 		 662 aa  190  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  27.87 
 
 		 667 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  27.87 
 
 		 667 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  27.64 
 
 		 667 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  25.07 
 
 		 672 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  25.21 
 
 		 703 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  25.74 
 
 		 698 aa  140  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  25.43 
 
 		 695 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  25.51 
 
 		 697 aa  139  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  25.59 
 
 		 699 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  25.48 
 
 		 693 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  25 
 
 		 695 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  26.35 
 
 		 699 aa  135  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  25 
 
 		 695 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  24.82 
 
 		 695 aa  134  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  24.85 
 
 		 695 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  24.85 
 
 		 695 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  24.82 
 
 		 695 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  24.82 
 
 		 695 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  24.68 
 
 		 711 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  24.23 
 
 		 704 aa  127  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  24.41 
 
 		 669 aa  126  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  24.2 
 
 		 706 aa  121  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  23.41 
 
 		 712 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  23.22 
 
 		 712 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  23.03 
 
 		 712 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  22.66 
 
 		 716 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  22.85 
 
 		 716 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  23.26 
 
 		 703 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  23.51 
 
 		 712 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  22.9 
 
 		 716 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  22.9 
 
 		 716 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  24.01 
 
 		 656 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  21.5 
 
 		 698 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  23.28 
 
 		 660 aa  55.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  24.6 
 
 		 681 aa  52.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>