More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0142 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03349  glutathione reductase  68.96 
 
 		 450 aa  634    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.470564  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0215  glutathione-disulfide reductase  68.96 
 
 		 450 aa  634    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0014  glutathione reductase  68.96 
 
 		 450 aa  641    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4084  glutathione reductase  70.29 
 
 		 450 aa  646    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.451157 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0120  glutathione reductase  73.61 
 
 		 451 aa  691    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3660  glutathione reductase  87.8 
 
 		 451 aa  836    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  0.767021 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00523  glutathione reductase  73.56 
 
 		 464 aa  677    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0142  glutathione reductase  100 
 
 		 451 aa  934    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4702  glutathione reductase  82.04 
 
 		 451 aa  781    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0114  glutathione reductase  70.29 
 
 		 450 aa  648    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3913  glutathione reductase  70.07 
 
 		 450 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03302  hypothetical protein  68.96 
 
 		 450 aa  634    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0216  glutathione reductase  68.96 
 
 		 450 aa  634    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.96555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0121  glutathione reductase  95.12 
 
 		 451 aa  895    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  80.49 
 
 		 451 aa  765    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4259  glutathione reductase  82.93 
 
 		 452 aa  789    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4186  glutathione reductase  69.62 
 
 		 450 aa  641    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3911  glutathione reductase  69.62 
 
 		 450 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0121  glutathione reductase  82.93 
 
 		 451 aa  788    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.848122  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4049  glutathione reductase  69.84 
 
 		 450 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3700  glutathione reductase  68.96 
 
 		 450 aa  634    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2568  glutathione reductase  73.61 
 
 		 451 aa  686    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3982  glutathione reductase  68.96 
 
 		 450 aa  634    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0084  glutathione reductase  82.48 
 
 		 451 aa  785    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3592  glutathione reductase  80.71 
 
 		 452 aa  766    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3789  glutathione reductase  69.4 
 
 		 450 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3972  glutathione reductase  69.62 
 
 		 450 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4068  glutathione reductase  86.47 
 
 		 451 aa  823    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4395  glutathione reductase  83.59 
 
 		 452 aa  793    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4714  glutathione reductase  68.51 
 
 		 450 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4206  glutathione-disulfide reductase  72.87 
 
 		 449 aa  658    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.486383  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4054  glutathione reductase  82.93 
 
 		 451 aa  788    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001954  glutathione reductase  72.73 
 
 		 451 aa  674    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3845  glutathione reductase  82.93 
 
 		 451 aa  788    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3938  glutathione reductase  82.71 
 
 		 451 aa  785    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3869  glutathione reductase  69.62 
 
 		 450 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3877  glutathione reductase  81.6 
 
 		 451 aa  777    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3803  glutathione reductase  69.62 
 
 		 450 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4471  glutathione reductase  69.18 
 
 		 450 aa  636    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4847  glutathione reductase  69.18 
 
 		 450 aa  638    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4220  glutathione reductase  83.15 
 
 		 452 aa  789    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3791  glutathione reductase  69.62 
 
 		 450 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.020575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03497  glutathione reductase  68.68 
 
 		 449 aa  632  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3822  glutathione reductase  68.74 
 
 		 450 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0013  glutathione reductase  67.85 
 
 		 450 aa  630  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.607831  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6145  glutathione-disulfide reductase  65.03 
 
 		 449 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6438  glutathione-disulfide reductase  65.26 
 
 		 449 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2356  glutathione-disulfide reductase  63.7 
 
 		 465 aa  598  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1106  glutathione reductase  64.47 
 
 		 456 aa  595  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2004  glutathione reductase  62.75 
 
 		 451 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0977143 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0507  glutathione-disulfide reductase  65.02 
 
 		 452 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243892  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1693  glutathione reductase  63.86 
 
 		 451 aa  578  1e-164  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0447  glutathione reductase  63.41 
 
 		 450 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.026364  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1966  glutathione reductase  62.08 
 
 		 451 aa  568  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4984  glutathione reductase  60.75 
 
 		 454 aa  548  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1375  glutathione reductase  55.43 
 
 		 449 aa  510  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  55.46 
 
 		 446 aa  498  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  54.99 
 
 		 451 aa  498  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  52.88 
 
 		 448 aa  461  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2396  glutathione-disulfide reductase  51.54 
 
 		 453 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0630  glutathione reductase  50.67 
 
 		 452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0614  glutathione reductase  50.22 
 
 		 452 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01560  glutathione-disulfide reductase, putative  52.89 
 
 		 479 aa  444  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0536  glutathione-disulfide reductase  50.66 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00586443  unclonable  0.0000000000392976 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0366  glutathione reductase  50.66 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736055  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0140  glutathione reductase  47.9 
 
 		 456 aa  429  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35819  glutathione reductase  50.98 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  47.01 
 
 		 457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42900  glutathione reductase  47.41 
 
 		 489 aa  403  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.113846 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00932  hypothetical glutathione reductase (Eurofung)  48.94 
 
 		 557 aa  393  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0509896 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  45.01 
 
 		 452 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  46.12 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  46.34 
 
 		 451 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  45.9 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  45.9 
 
 		 451 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  45.9 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  47.01 
 
 		 452 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  46.12 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  44.74 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  45.23 
 
 		 452 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49167  glutathione-disulfide reductase  47.6 
 
 		 507 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  44.57 
 
 		 452 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  43.9 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2883  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.76 
 
 		 452 aa  362  6e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  43.46 
 
 		 449 aa  352  7e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  42.95 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  42.95 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.96 
 
 		 452 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  41.54 
 
 		 450 aa  343  5e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  40.97 
 
 		 460 aa  342  5.999999999999999e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  39.82 
 
 		 459 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  40.66 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.92 
 
 		 453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  39.78 
 
 		 459 aa  336  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  40.94 
 
 		 452 aa  332  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1875  NADPH-glutathione reductase  42.2 
 
 		 454 aa  329  7e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105853  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1857  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.83 
 
 		 466 aa  329  8e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0473556  normal  0.430164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3544  glutathione-disulfide reductase  41.39 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  38.72 
 
 		 459 aa  325  9e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.65 
 
 		 457 aa  322  6e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>