24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8906 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8906  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  400  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  42 
 
 		 514 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2210  hypothetical protein  37.76 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356074  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  54.29 
 
 		 428 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0811  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  31.11 
 
 		 3242 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.49 
 
 		 14916 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1469  hypothetical protein  34.33 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000606848  normal  0.0260491 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  36.52 
 
 		 746 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2952  hypothetical protein  53.47 
 
 		 334 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000079303  hitchhiker  0.000181549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3636  hypothetical protein  24.73 
 
 		 262 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00420  FHA domain-containing protein  56.25 
 
 		 406 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.295501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  50.68 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0655  Pericardin like protein  42.5 
 
 		 684 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.541208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.58 
 
 		 751 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0231  hypothetical protein  38.6 
 
 		 135 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  47.5 
 
 		 433 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0068  hypothetical protein  54.9 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4674  cell surface protein  34.72 
 
 		 939 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0699989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  31.82 
 
 		 1079 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  48.35 
 
 		 323 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1111 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31407  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  30.34 
 
 		 163 aa  42  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3984  hypothetical protein  32.5 
 
 		 742 aa  42  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580722  hitchhiker  0.00476383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>