290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6756 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6756  ATPase with chaperone activity ATP-binding subunit-like protein  100 
 
 
250 aa  485  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1985  Clp domain protein  53.44 
 
 
229 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  36.22 
 
 
836 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  36.22 
 
 
837 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  36.73 
 
 
841 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  39.76 
 
 
830 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  40.48 
 
 
855 aa  105  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  41.1 
 
 
839 aa  105  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  39.77 
 
 
836 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  39.34 
 
 
844 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  37.56 
 
 
851 aa  105  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  38.64 
 
 
851 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  39.77 
 
 
844 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  37.06 
 
 
834 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  37.56 
 
 
834 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  40.61 
 
 
835 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  36.18 
 
 
830 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  36.55 
 
 
852 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  36.82 
 
 
834 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  38.8 
 
 
854 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  39.43 
 
 
842 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  41.78 
 
 
850 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  37.81 
 
 
858 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  41.26 
 
 
812 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  42.47 
 
 
847 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  36 
 
 
848 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  42.47 
 
 
848 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  42.47 
 
 
847 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  42.47 
 
 
847 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  42.47 
 
 
847 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  42.47 
 
 
847 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  38.92 
 
 
846 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  40.41 
 
 
861 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  39.88 
 
 
858 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  41.1 
 
 
830 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  35.2 
 
 
852 aa  99.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  40 
 
 
868 aa  98.6  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  35.68 
 
 
840 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  39.73 
 
 
810 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  41.67 
 
 
851 aa  97.4  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0603  ATPase AAA-2 domain protein  38.57 
 
 
852 aa  95.9  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0740742  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  36.99 
 
 
866 aa  95.5  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3404  ATPase AAA-2 domain protein  40.41 
 
 
843 aa  95.5  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  32.46 
 
 
823 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  36.25 
 
 
829 aa  92.8  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  37.89 
 
 
834 aa  93.2  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  39.86 
 
 
812 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  39.46 
 
 
812 aa  92  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3476  Clp domain protein  36.54 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.689298  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  36.14 
 
 
879 aa  91.3  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  33.75 
 
 
814 aa  89.4  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5711  Clp domain protein  39.87 
 
 
240 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  31.77 
 
 
824 aa  89.4  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  35.19 
 
 
822 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  35.19 
 
 
822 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  31.77 
 
 
810 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  35.19 
 
 
821 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  31.41 
 
 
824 aa  88.6  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0559  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  36.36 
 
 
870 aa  87.8  1e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  31.94 
 
 
825 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  31.41 
 
 
825 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  37.06 
 
 
859 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  32.64 
 
 
811 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  37.06 
 
 
855 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  37.06 
 
 
855 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  37.06 
 
 
843 aa  86.3  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  37.06 
 
 
846 aa  86.3  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  32.29 
 
 
812 aa  85.9  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  38.17 
 
 
818 aa  85.9  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  36.43 
 
 
811 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000555448  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  36.43 
 
 
811 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  36.43 
 
 
811 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  36.43 
 
 
811 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  36.36 
 
 
859 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  36.43 
 
 
811 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  36.43 
 
 
811 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  36.43 
 
 
811 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  34.16 
 
 
811 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  36.43 
 
 
811 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  30.93 
 
 
843 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6891  ATPase  34.38 
 
 
944 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440431  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  36.43 
 
 
811 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  36.36 
 
 
811 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5492  ATPase AAA-2 domain protein  34.9 
 
 
944 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.311641  normal  0.315903 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  38.93 
 
 
828 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  31.49 
 
 
842 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  35.66 
 
 
842 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  35.66 
 
 
841 aa  82.4  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  33.79 
 
 
825 aa  82.4  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  38.4 
 
 
869 aa  81.3  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  34.68 
 
 
820 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  37.6 
 
 
862 aa  80.5  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5168  Clp domain protein  36.13 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5916  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  40.17 
 
 
942 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189322  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  33.96 
 
 
815 aa  78.6  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  34.48 
 
 
814 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2678  ATPase  32.53 
 
 
840 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 
1711 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00870  ATPase AAA-2 domain protein  34.67 
 
 
806 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000509164  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  30.56 
 
 
854 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>