33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4880 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4880  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  867    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.556071  normal  0.0123337 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2523  hypothetical protein  26.92 
 
 		 641 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00103987  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1269  hypothetical protein  25.5 
 
 		 528 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0139  hypothetical protein  25.5 
 
 		 528 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1757  hypothetical protein  25.5 
 
 		 528 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.308212  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1963  hypothetical protein  25.17 
 
 		 528 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1791  hypothetical protein  25.5 
 
 		 528 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0910077  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1811  hypothetical protein  25.17 
 
 		 528 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4095  hypothetical protein  26.61 
 
 		 563 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1023  hypothetical protein  24.07 
 
 		 477 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  26.38 
 
 		 473 aa  53.9  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  24.7 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  25.29 
 
 		 468 aa  50.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  25.64 
 
 		 512 aa  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  24.38 
 
 		 468 aa  49.7  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  24.06 
 
 		 481 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  29.27 
 
 		 487 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  24.31 
 
 		 468 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  23.27 
 
 		 468 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  25.48 
 
 		 440 aa  46.6  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  24 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  25.11 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  24.48 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  23.26 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  23.24 
 
 		 469 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  23.27 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  22.96 
 
 		 468 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  32.63 
 
 		 481 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  27.88 
 
 		 394 aa  44.3  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  21.5 
 
 		 325 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  26.32 
 
 		 318 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  31.82 
 
 		 529 aa  43.5  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  23.02 
 
 		 468 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>