49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4365 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4365  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  353  5.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3961  putative transposase  84.88 
 
 
341 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3263  hypothetical protein  43.09 
 
 
376 aa  97.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5772  hypothetical protein  77.19 
 
 
61 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9055  hypothetical protein  43.55 
 
 
373 aa  95.9  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1237  putative transposase  42.28 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2127  putative transposase  42.28 
 
 
224 aa  90.9  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  35.96 
 
 
387 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  35.96 
 
 
387 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  35.96 
 
 
387 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1919  hypothetical protein  32.77 
 
 
217 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1258  IS630 family transposase  32.77 
 
 
180 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3067  IS630 family transposase  32.77 
 
 
180 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  30.63 
 
 
391 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0520  hypothetical protein  32.77 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.11 
 
 
350 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  44.3  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  28.23 
 
 
377 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
349 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  28.23 
 
 
377 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  28.23 
 
 
377 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  28.23 
 
 
377 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  28.23 
 
 
377 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  28.23 
 
 
377 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  28.23 
 
 
377 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  28.23 
 
 
377 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  28.23 
 
 
377 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  28.23 
 
 
377 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  28.23 
 
 
377 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1476  putative transposase protein  28.69 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1513  transposase of IS642-like element  33.72 
 
 
145 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.34 
 
 
350 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3111  hypothetical protein  33.59 
 
 
440 aa  41.6  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000021328 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>