44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1513 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1513  transposase of IS642-like element  100 
 
 
145 aa  298  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3129  transposase of IS653-like element  47.5 
 
 
187 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  45.83 
 
 
355 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  45.83 
 
 
355 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  45.83 
 
 
355 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.43 
 
 
350 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.61 
 
 
350 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4058  transposase and inactivated derivative  27.38 
 
 
169 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.407481  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  30 
 
 
366 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1059  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482795  normal  0.334921 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  29.17 
 
 
365 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1818  hypothetical protein  26.85 
 
 
208 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327854  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2195  hypothetical protein  26.85 
 
 
208 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4210  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4365  hypothetical protein  33.72 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2955  hypothetical protein  26.85 
 
 
288 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2774  transposase  30.85 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000655562  normal  0.0461255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  38.67 
 
 
348 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  38.67 
 
 
348 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0769  IS630 family transposase  25.89 
 
 
195 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3886  IS630 family transposase  30.43 
 
 
167 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00228342  normal  0.0587286 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  37.33 
 
 
348 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  37.33 
 
 
348 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  37.33 
 
 
348 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  37.33 
 
 
348 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3854  hypothetical protein  31.48 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.15629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>