41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2982 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2148  band 7 protein  66.53 
 
 		 538 aa  652    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2982  hypothetical protein  100 
 
 		 536 aa  1075    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.688388  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3324  band 7 protein  56.91 
 
 		 607 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0385  hypothetical protein  58.72 
 
 		 504 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.747749  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3323  band 7 protein  30.71 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2981  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  31.67 
 
 		 415 aa  136  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0384  band 7 protein  30.62 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.0305659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2147  band 7 protein  30.23 
 
 		 450 aa  125  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.235634  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  23.25 
 
 		 420 aa  50.4  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  25.65 
 
 		 420 aa  50.1  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  23.42 
 
 		 418 aa  50.4  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  23.3 
 
 		 402 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.85 
 
 		 315 aa  47  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  26.03 
 
 		 305 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.17 
 
 		 315 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  25.17 
 
 		 315 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.17 
 
 		 315 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.17 
 
 		 315 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.17 
 
 		 315 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.17 
 
 		 315 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.17 
 
 		 315 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  22.54 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  22.54 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  22.54 
 
 		 419 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  22.54 
 
 		 419 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  22.54 
 
 		 419 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2312  band 7 protein  22.58 
 
 		 473 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180673  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  23.97 
 
 		 308 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3796  FtsH protease regulator HflK  22.86 
 
 		 420 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  23.29 
 
 		 309 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0697  FtsH protease regulator HflK  22.86 
 
 		 419 aa  44.3  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  21 
 
 		 345 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3651  FtsH protease regulator HflK  22.86 
 
 		 420 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3992  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.39 
 
 		 296 aa  44.3  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  23.33 
 
 		 311 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0433  FtsH protease regulator HflK  22.12 
 
 		 419 aa  43.9  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0562883  unclonable  0.0000000348967 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  23.33 
 
 		 311 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  23.33 
 
 		 311 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  19.7 
 
 		 311 aa  43.5  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  28.18 
 
 		 286 aa  43.5  0.009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  23.81 
 
 		 317 aa  43.5  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.887258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>