42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2981 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2981  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  100 
 
 		 415 aa  829    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0384  band 7 protein  70.62 
 
 		 411 aa  574  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.0305659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3323  band 7 protein  67.47 
 
 		 488 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2147  band 7 protein  69.62 
 
 		 450 aa  547  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.235634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2982  hypothetical protein  31.67 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.688388  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2148  band 7 protein  28.93 
 
 		 538 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3324  band 7 protein  28.46 
 
 		 607 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0385  hypothetical protein  29.77 
 
 		 504 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.747749  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  25.7 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.94 
 
 		 304 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0881  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.61 
 
 		 336 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  22.52 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3437  band 7 protein  21.89 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.462208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  23.63 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  20.33 
 
 		 305 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  22.89 
 
 		 304 aa  50.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.89 
 
 		 304 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  25.29 
 
 		 333 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0932  band 7 protein  24.39 
 
 		 336 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0929  band 7 protein  24.39 
 
 		 336 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0923  putative HflC protein  26.42 
 
 		 290 aa  48.9  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02636  integral membrane protease subunit  23.88 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  20.86 
 
 		 303 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  23.59 
 
 		 286 aa  47  0.0006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  27.12 
 
 		 305 aa  46.6  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  25 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  24.24 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2736  band 7 protein  24.65 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.63 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  26.6 
 
 		 265 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  26.59 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.5 
 
 		 257 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  22.99 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.86 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  21.63 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  27.36 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  27.84 
 
 		 284 aa  43.9  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  22.97 
 
 		 303 aa  43.5  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  24.46 
 
 		 261 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  26.8 
 
 		 445 aa  43.1  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0297  band 7 protein  22.67 
 
 		 284 aa  43.1  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22550  band 7 protein  22.18 
 
 		 330 aa  43.1  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>