More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0556 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0266  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  81.71 
 
 
432 aa  711    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0759281  normal  0.802999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0556  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  100 
 
 
437 aa  877    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0652148  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4434  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  75.06 
 
 
431 aa  637    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8084  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  70.67 
 
 
439 aa  609  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2726  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  73.97 
 
 
430 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4359  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  71.94 
 
 
431 aa  599  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.803676 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0054  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  70.31 
 
 
432 aa  598  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0412584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6123  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  71.81 
 
 
449 aa  585  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4575  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  71.79 
 
 
461 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0507  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  71.81 
 
 
452 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.233971  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0864  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  68.51 
 
 
432 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0270519  normal  0.0209864 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1034  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  68.67 
 
 
444 aa  571  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.480011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6719  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  68.35 
 
 
431 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0683  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67.8 
 
 
438 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113257  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0690  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67.8 
 
 
438 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0921511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0703  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67.8 
 
 
438 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4520  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  70.98 
 
 
444 aa  558  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228286  decreased coverage  0.000903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4100  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  70.24 
 
 
448 aa  557  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0626  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  68.25 
 
 
448 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.309462  normal  0.0190729 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02920  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  66.99 
 
 
434 aa  548  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0136476  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0829  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  67.8 
 
 
432 aa  545  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.993042 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0687  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  66.59 
 
 
439 aa  543  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0597832  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10535  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  64.01 
 
 
462 aa  537  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0499  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  66.36 
 
 
445 aa  535  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24370  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  65.3 
 
 
448 aa  534  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1541  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  68.1 
 
 
436 aa  528  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.581966  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0231  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  64.95 
 
 
437 aa  509  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.469034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3255  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  63.92 
 
 
439 aa  507  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2485  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.66 
 
 
443 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000485626 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26820  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  61.52 
 
 
440 aa  501  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36080  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  62.95 
 
 
442 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00323277  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2763  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.12 
 
 
447 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2495  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  60.05 
 
 
442 aa  488  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0124376  normal  0.154448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3440  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  60.19 
 
 
456 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00303308  decreased coverage  0.00133947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4015  aminotransferase class-III  54.83 
 
 
491 aa  473  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.811314  normal  0.735533 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15130  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.31 
 
 
441 aa  461  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  49.65 
 
 
626 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  52.63 
 
 
428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  54.57 
 
 
431 aa  450  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  52.57 
 
 
429 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  51.44 
 
 
432 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1300  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  52.53 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.9 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.395249  normal  0.0453126 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00650  Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50.72 
 
 
426 aa  440  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2893  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  52.64 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000688047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  52.4 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1119  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  52.05 
 
 
430 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4480  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.75 
 
 
430 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.786256  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3177  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50.61 
 
 
429 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  52.18 
 
 
428 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50.35 
 
 
430 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  54.59 
 
 
437 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4344  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.28 
 
 
430 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4499  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.75 
 
 
430 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3098  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.78 
 
 
427 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0806  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.25 
 
 
429 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132549  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3071  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  52.16 
 
 
430 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.049853  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0839  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  52.67 
 
 
427 aa  435  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50.59 
 
 
430 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1088  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  51.65 
 
 
428 aa  435  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.80886  normal  0.019309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50.35 
 
 
430 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50.35 
 
 
430 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0896  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.07 
 
 
427 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50.94 
 
 
428 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.154612  hitchhiker  0.0000102166 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4579  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  51.09 
 
 
429 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4552  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  51.09 
 
 
429 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0655  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  51.09 
 
 
428 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4194  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  52.11 
 
 
429 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4205  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  51.09 
 
 
429 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2156  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  50.36 
 
 
432 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4306  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  51.61 
 
 
429 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4548  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  52.11 
 
 
429 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0042  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  52.35 
 
 
430 aa  428  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4597  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  51.09 
 
 
429 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.57 
 
 
426 aa  429  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.956002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1148  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  49.64 
 
 
430 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4358  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  51.86 
 
 
429 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3551  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  51.95 
 
 
429 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0558  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.15 
 
 
433 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.655288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0266  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.32 
 
 
427 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4065  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.48 
 
 
427 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149414  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0285  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  51.54 
 
 
430 aa  425  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50.84 
 
 
427 aa  425  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000584172  hitchhiker  0.00810852 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4693  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  51.86 
 
 
429 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  51.09 
 
 
430 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0822  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.99 
 
 
427 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1340  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  53.01 
 
 
432 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  49.64 
 
 
428 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1492  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  49.4 
 
 
429 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  51.67 
 
 
428 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2033  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.94 
 
 
434 aa  423  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1753  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.97 
 
 
427 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.719453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0482  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.99 
 
 
427 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0831  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.75 
 
 
427 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2012  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  49.88 
 
 
451 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.919837  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.99 
 
 
427 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0610  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.33 
 
 
433 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1199  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  51.31 
 
 
437 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2800  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50.47 
 
 
431 aa  420  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.279066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4548  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  52.53 
 
 
431 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.773793  normal  0.133207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>