41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2926 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1415    86.92 
 
 		 920 bp  797    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00216347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2926    100 
 
 		 956 bp  1895    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.937376  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3831    95 
 
 		 120 bp  190  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000769405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1939    96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.7341  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  96.77 
 
 		 597 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4183    96.77 
 
 		 1679 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0125    96.77 
 
 		 268 bp  54  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  94.29 
 
 		 906 bp  54  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  96.77 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2887    90.48 
 
 		 153 bp  52  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2998    90.24 
 
 		 919 bp  50.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  93.94 
 
 		 924 bp  50.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  93.94 
 
 		 924 bp  50.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  90.24 
 
 		 738 bp  50.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  90.24 
 
 		 681 bp  50.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0294    96.43 
 
 		 304 bp  48.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0614    91.67 
 
 		 857 bp  48.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2137    88.33 
 
 		 923 bp  48.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00245844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  100 
 
 		 861 bp  48.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>