85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1591 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1730  patatin  89.03 
 
 
372 aa  695    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  88.51 
 
 
372 aa  694    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  100 
 
 
383 aa  791    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  90.6 
 
 
380 aa  710    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  88.25 
 
 
372 aa  691    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  74.38 
 
 
335 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  73.77 
 
 
335 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  74.29 
 
 
344 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  67.36 
 
 
415 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  60.12 
 
 
378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  50.92 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  48.19 
 
 
343 aa  315  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  37.54 
 
 
638 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  38.36 
 
 
422 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  38.36 
 
 
424 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  38.05 
 
 
422 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  37.11 
 
 
373 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.52912 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  35.06 
 
 
357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  35.06 
 
 
357 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  35.06 
 
 
357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  35.06 
 
 
357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  35.06 
 
 
357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  34.76 
 
 
357 aa  196  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  34.76 
 
 
357 aa  196  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  34.76 
 
 
357 aa  196  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  34.45 
 
 
357 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  35.85 
 
 
357 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  35.53 
 
 
364 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  35.53 
 
 
364 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  34.17 
 
 
364 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  35.53 
 
 
357 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  35.22 
 
 
356 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  30.91 
 
 
282 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  29.89 
 
 
381 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  30.77 
 
 
305 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  29.78 
 
 
290 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  29.02 
 
 
290 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  33.33 
 
 
389 aa  133  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  35.4 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  31.15 
 
 
290 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  27.02 
 
 
287 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  24.68 
 
 
279 aa  89.4  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  24.68 
 
 
279 aa  86.7  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  26.88 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  22.88 
 
 
283 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  29.18 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  26.92 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  25.18 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  26.92 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  22.71 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  23.03 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  25.08 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  22.71 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  22.71 
 
 
284 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  22.71 
 
 
284 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  23.44 
 
 
283 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  22.71 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  22.71 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  28.33 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  22.71 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  22.71 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  28.76 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  28.76 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  23.03 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  22.54 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  23.84 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  27.39 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  23.44 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  23.44 
 
 
283 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  23.81 
 
 
283 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  23.44 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  23.44 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  30.41 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  25.71 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  26.87 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  26.22 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  26.29 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  30.07 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  23.17 
 
 
284 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  22.83 
 
 
296 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  24.9 
 
 
283 aa  60.5  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  21.35 
 
 
270 aa  57  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  37.78 
 
 
320 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  26.39 
 
 
313 aa  46.2  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  23.98 
 
 
314 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>