51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0626 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  58.23 
 
 		 669 aa  805    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  58.17 
 
 		 668 aa  797    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  94.41 
 
 		 662 aa  1292    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  56.97 
 
 		 668 aa  771    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  63.27 
 
 		 667 aa  895    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  100 
 
 		 662 aa  1348    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  57.93 
 
 		 668 aa  804    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  64.62 
 
 		 667 aa  912    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  64.62 
 
 		 667 aa  912    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  53.06 
 
 		 674 aa  703    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  49.7 
 
 		 672 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  53.29 
 
 		 669 aa  741    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  57.42 
 
 		 668 aa  786    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  37.52 
 
 		 699 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  37.65 
 
 		 669 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  36.86 
 
 		 698 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  35.52 
 
 		 699 aa  411  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  36.74 
 
 		 693 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  36.15 
 
 		 695 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  37.65 
 
 		 672 aa  403  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  34.91 
 
 		 695 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  35.87 
 
 		 695 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  35.87 
 
 		 695 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  34.04 
 
 		 703 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  35.67 
 
 		 697 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  34.29 
 
 		 695 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  34.29 
 
 		 695 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  34.29 
 
 		 695 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  34.15 
 
 		 695 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  34.18 
 
 		 704 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  32.28 
 
 		 706 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  30.14 
 
 		 716 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  30.24 
 
 		 712 aa  319  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  29.81 
 
 		 712 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  30.87 
 
 		 716 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  30 
 
 		 716 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  30 
 
 		 716 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  29.53 
 
 		 712 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  29.49 
 
 		 712 aa  301  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  31.42 
 
 		 703 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  29.76 
 
 		 711 aa  296  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  29.36 
 
 		 656 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  27.67 
 
 		 698 aa  251  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  28.04 
 
 		 565 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  28.83 
 
 		 573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  25.77 
 
 		 660 aa  154  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  24.85 
 
 		 681 aa  139  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  24.1 
 
 		 706 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  20.66 
 
 		 772 aa  72.8  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  21.43 
 
 		 807 aa  64.7  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  20 
 
 		 835 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>