42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0010 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  308  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  83.78 
 
 
148 aa  254  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  83.11 
 
 
148 aa  254  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  82.43 
 
 
148 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000149396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  82.43 
 
 
148 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  79.17 
 
 
145 aa  237  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  78.47 
 
 
145 aa  236  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  78.47 
 
 
145 aa  234  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  0.0000000172861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  78.32 
 
 
145 aa  228  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  63.7 
 
 
146 aa  199  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  66.9 
 
 
147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  62.76 
 
 
146 aa  193  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  64.83 
 
 
145 aa  192  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  64.79 
 
 
149 aa  189  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000770125  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  59.87 
 
 
155 aa  183  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  42.67 
 
 
151 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  37.5 
 
 
156 aa  80.1  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  34.75 
 
 
206 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  29.58 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  38.18 
 
 
178 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  31.88 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  29.01 
 
 
181 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  33.6 
 
 
184 aa  53.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0430  MOSC domain-containing protein  30.87 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.458415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  31.78 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  25.33 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  29.37 
 
 
182 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  31.48 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  28.17 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  30.89 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  31.03 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  30.39 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  32.17 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  25.69 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0846  MOSC domain-containing protein  27.36 
 
 
214 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  normal  0.0737228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  29.06 
 
 
174 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  30.26 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1925  hypothetical protein  26.83 
 
 
226 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0371  MOSC domain-containing protein  23.61 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  28.21 
 
 
177 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0155  hypothetical protein  32.39 
 
 
205 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1839  3-alpha:MOSC  30.77 
 
 
241 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>