More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1400 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1400  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
326 aa  658    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3512  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  47.19 
 
 
321 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3496  quinone oxidoreductase  47.5 
 
 
321 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1766  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  47.19 
 
 
321 aa  287  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0377504  normal  0.772625 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0277  alcohol dehydrogenase  45.45 
 
 
319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3193  alcohol dehydrogenase  48.28 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3200  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  46.88 
 
 
321 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3501  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  46.25 
 
 
321 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3286  quinone oxidoreductase  45.94 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.635243  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3544  quinone oxidoreductase  45.94 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.752673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3256  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  45.94 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3483  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  46.56 
 
 
321 aa  278  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.265979  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2374  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.45 
 
 
327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220346  normal  0.0293571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.84 
 
 
321 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2517  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.51 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0419474  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 
325 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.12 
 
 
322 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.35 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  36.22 
 
 
319 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0233  quinone oxidoreductase  38.86 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.21 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.69 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3381  NAD(P)H -dependent quinone oxidoreductase  39.81 
 
 
324 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.41624  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5040  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.67 
 
 
323 aa  179  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13939  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7384  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.2 
 
 
325 aa  178  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.7 
 
 
319 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22350  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  37.72 
 
 
327 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.2 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  35.87 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3027  alcohol dehydrogenase  38.7 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.89 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14430  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  39.01 
 
 
333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.587112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  39.08 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.85 
 
 
326 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 
321 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1821  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.65 
 
 
322 aa  172  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00168562  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  38.77 
 
 
325 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.82 
 
 
326 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2197  putative quinone oxidoreductase  37.05 
 
 
323 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51788  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1920  putative quinone oxidoreductase  37.05 
 
 
323 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0935  putative quinone oxidoreductase  37.05 
 
 
331 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1221  putative quinone oxidoreductase  37.05 
 
 
331 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.908544  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1683  quinone oxidoreductase, putative  37.05 
 
 
323 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0232  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.05 
 
 
323 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
324 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.63 
 
 
323 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.11 
 
 
322 aa  170  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0322  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.75 
 
 
331 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 
321 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
324 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
325 aa  169  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.09 
 
 
327 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.77 
 
 
323 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.77 
 
 
320 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
328 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  36.14 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.28 
 
 
324 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  36.78 
 
 
325 aa  166  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3861  hypothetical protein  38.92 
 
 
324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
324 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
324 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.46 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2841  alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.5 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  34.97 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.45 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.2 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5329  alcohol dehydrogenase  35.08 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.780994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1477  alcohol dehydrogenase  36 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
330 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.02 
 
 
317 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0480145  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  35.08 
 
 
324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.65 
 
 
318 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.59 
 
 
324 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
326 aa  162  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.54 
 
 
331 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.08 
 
 
324 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.12 
 
 
321 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
324 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.69 
 
 
324 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
324 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
325 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
324 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1325  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.2 
 
 
327 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1039  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.42 
 
 
321 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  37.69 
 
 
323 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.25 
 
 
324 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 
324 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.65 
 
 
326 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 
331 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
325 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01030  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  34.65 
 
 
325 aa  159  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
344 aa  158  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>