34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0060 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0060  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 250 aa  511  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0170  xylose isomerase domain-containing protein  57.2 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26880  hypothetical protein  44.31 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0781566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3415  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.87 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35360  hypothetical protein  40.65 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101497  normal  0.0806512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1487  xylose isomerase domain-containing protein  39.2 
 
 		 271 aa  151  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2901  xylose isomerase-like TIM barrel  38.46 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2980  hypothetical protein  39.43 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2568  xylose isomerase domain-containing protein  38.93 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.661441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2565  xylose isomerase domain-containing protein  39.76 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743333  normal  0.137463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2379  xylose isomerase domain-containing protein  38.71 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1254  xylose isomerase domain-containing protein  36.8 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3379  xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.5 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0755  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.71 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0500  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.09 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0428613  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0689  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.86 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.208396  normal  0.278119 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1734  xylose isomerase domain-containing protein  37.35 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6345  xylose isomerase-like TIM barrel  37.35 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1747  xylose isomerase domain-containing protein  37.2 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.907837 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1655  xylose isomerase domain-containing protein  37.92 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.131538  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1655  xylose isomerase domain-containing protein  37.24 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.71258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1979  putative epimerase, KguE-like  35.57 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0445694 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1525  xylose isomerase domain-containing protein  36.73 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.394526  normal  0.900622 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5030  xylose isomerase-like TIM barrel  35.48 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2279  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.99 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2295  hypothetical protein  37.34 
 
 		 350 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2097  hypothetical protein  39.74 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1669  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.41 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000240726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2155  hypothetical protein  38.46 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.313298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2289  AP endonuclease  38.46 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0128  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.33 
 
 		 247 aa  92  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.334205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0960  hypothetical protein  38.89 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1802  hypothetical protein  29.02 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3065  xylose isomerase-like  26.67 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>