47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3860 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  78.88 
 
 		 565 aa  943    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  100 
 
 		 573 aa  1174    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  29.69 
 
 		 669 aa  211  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  28.89 
 
 		 668 aa  209  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  28.7 
 
 		 668 aa  204  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  28.61 
 
 		 669 aa  203  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  28.17 
 
 		 668 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  28.44 
 
 		 667 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  29.56 
 
 		 672 aa  194  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  27.79 
 
 		 667 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  28.64 
 
 		 662 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  28.66 
 
 		 674 aa  187  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  27.26 
 
 		 668 aa  186  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  28.83 
 
 		 662 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  27.79 
 
 		 667 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  26.59 
 
 		 672 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  27 
 
 		 669 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  26.74 
 
 		 698 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  26.53 
 
 		 693 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  23.7 
 
 		 703 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  25.66 
 
 		 699 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  28.09 
 
 		 699 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  25.57 
 
 		 695 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  24.11 
 
 		 695 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  25.98 
 
 		 704 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  24.11 
 
 		 695 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  24.57 
 
 		 697 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  23.97 
 
 		 695 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  23.97 
 
 		 695 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  25.67 
 
 		 695 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  25.48 
 
 		 695 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  25.86 
 
 		 695 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  23.48 
 
 		 706 aa  114  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  25.66 
 
 		 656 aa  114  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  23.89 
 
 		 712 aa  110  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  23.7 
 
 		 712 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  23.33 
 
 		 712 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  23.11 
 
 		 716 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  22.79 
 
 		 716 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  23.57 
 
 		 711 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  23.63 
 
 		 703 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  22.69 
 
 		 716 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  22.66 
 
 		 716 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  22.22 
 
 		 712 aa  92.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  20.42 
 
 		 698 aa  61.6  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  23.43 
 
 		 660 aa  57  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  23.55 
 
 		 772 aa  44.3  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>