28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1815 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1815  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 380 aa  783    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1879  TPR repeat-containing protein  44.19 
 
 		 388 aa  332  9e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2760  TPR repeat-containing protein  44.04 
 
 		 392 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258861  normal  0.160346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1794  TPR repeat-containing protein  39.79 
 
 		 416 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1445  hypothetical protein  35.26 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000257118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0983  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.145285 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0836  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293971  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0757  TPR domain-containing protein  28.76 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4983  TPR domain-containing protein  31.72 
 
 		 278 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0849  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 		 393 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00820886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0653  TPR domain-containing protein  27.51 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3529  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3359  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.811599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2902  tetratricopeptide TPR_2  26.09 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.449948  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0594  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.212365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0936  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0800  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 397 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.014788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3705  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000033956  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3647  Tetratricopeptide domain protein  29.79 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000857085  hitchhiker  0.00481631 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3829  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0626  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13673  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2703  TPR domain-containing protein  27.42 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0530  tetratricopeptide TPR_2  24.16 
 
 		 392 aa  96.7  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00726  TPR domain protein  23.48 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2168  hypothetical protein  25.27 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.95 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4120  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.13 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>