16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5986 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5986  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  315  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.268183  normal  0.461112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0229  hypothetical protein  52.81 
 
 
175 aa  164  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457636  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0201  hypothetical protein  51.15 
 
 
174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2019  hypothetical protein  35.1 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6532  hypothetical protein  37.35 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779684  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4830  hypothetical protein  35.12 
 
 
162 aa  77  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0026  hypothetical protein  32.35 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9320  hypothetical protein  32.53 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3537  hypothetical protein  32.12 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0281  hypothetical protein  34.76 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9321  hypothetical protein  30.77 
 
 
169 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3538  hypothetical protein  27.45 
 
 
166 aa  48.5  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4940  hypothetical protein  32.34 
 
 
145 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0470  hypothetical protein  32.26 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.261542  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36890  hypothetical protein  33.14 
 
 
160 aa  45.1  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0678553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4939  hypothetical protein  27.61 
 
 
162 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>