20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4042 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4042  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  724    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00590442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0129  hypothetical protein  65.1 
 
 
364 aa  462  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1533  hypothetical protein  52.86 
 
 
393 aa  333  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3359  hypothetical protein  35.11 
 
 
374 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00157924  normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  29.25 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  30.32 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  31.09 
 
 
385 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  34.39 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4021  hypothetical protein  31.9 
 
 
393 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000017114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  34.88 
 
 
389 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1142  hypothetical protein  27.32 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.202037  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  30.54 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3558  hypothetical protein  24.7 
 
 
390 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  35.93 
 
 
355 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  27.59 
 
 
373 aa  56.6  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  31.52 
 
 
393 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1142  hypothetical protein  23.98 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.561604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  30.86 
 
 
394 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  30.93 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2788  hypothetical protein  27.52 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>