30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1688 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1688  cysteine dioxygenase type I  100 
 
 		 153 aa  314  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287539  normal  0.148043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0473  cysteine dioxygenase type I  48.28 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1387  cysteine dioxygenase type I  46.9 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240375  normal  0.0417465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5989  cysteine dioxygenase type I  45.13 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4168  cysteine dioxygenase type I  42.15 
 
 		 176 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4234  cysteine dioxygenase type I  42.15 
 
 		 176 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4390  cysteine dioxygenase type I  42.15 
 
 		 176 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2234  cysteine dioxygenase type I  46.3 
 
 		 167 aa  87.8  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3083  cysteine dioxygenase type I  44.86 
 
 		 165 aa  87  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.569754  normal  0.0821213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11083  hypothetical protein  38.76 
 
 		 188 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.334269999999999e-45  normal  0.140472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3322  cysteine dioxygenase type I  36.02 
 
 		 195 aa  85.5  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1484  cysteine dioxygenase type I  37.88 
 
 		 228 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.346783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1317  cysteine dioxygenase type I  34.51 
 
 		 168 aa  84  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  38.57 
 
 		 294 aa  81.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2033  cysteine dioxygenase type I  41.74 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4981  cysteine dioxygenase type I  39.66 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal  0.731628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4684  cysteine dioxygenase type I  40.8 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0553076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6068  cysteine dioxygenase type I  48.15 
 
 		 207 aa  77.4  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7922  hypothetical protein  33.11 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1290  cysteine dioxygenase type I  35.07 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0248002  normal  0.323181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1288  cysteine dioxygenase type I  31.91 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198462  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4230  cysteine dioxygenase type I  38.32 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1508  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily-like protein  29.86 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.221048 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2602  hypothetical protein  29.35 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000300712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2559  cysteine dioxygenase type I superfamily  29.35 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09140  cupin domain-containing protein  44.64 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5442  cysteine dioxygenase type I  30.83 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124892  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2860  metal-dependent protein  28.93 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2309  cysteine dioxygenase type I  30.77 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54991  normal  0.0277582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1987  cysteine dioxygenase type I  29.23 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.935049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>