More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6081 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6081  acyl carrier protein  100 
 
 		 83 aa  161  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4850  acyl carrier protein  86.75 
 
 		 83 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.633798  normal  0.0406767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1903  acyl carrier protein  79.52 
 
 		 83 aa  135  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0925633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 79 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 79 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  43.75 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  47.83 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  51.32 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  49.33 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  46.05 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  50 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  46.38 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  46.38 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  46.38 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  46.38 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  45.21 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 78 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 78 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 78 aa  73.9  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  47.3 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  45.95 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  46.05 
 
 		 77 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  45.95 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  46.05 
 
 		 77 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  46.05 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  43.84 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  45.95 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 80 aa  70.5  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  44.16 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  46.58 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  46.58 
 
 		 77 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  49.25 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  47.3 
 
 		 77 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  41.89 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  49.25 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  46.58 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  45.21 
 
 		 77 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  47.3 
 
 		 77 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  41.1 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  48.65 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  48.65 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  48.65 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  48.65 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  40.28 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  48.65 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  48.65 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  48.65 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  43.06 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  48.65 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  48.65 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  48.65 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  40.28 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  46.05 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  47.3 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  43.84 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  38.96 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 78 aa  67  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  43.04 
 
 		 82 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 83 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  40 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 77 aa  67  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  41.33 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  40.28 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  47.76 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  47.76 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  40.58 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0225  acyl carrier protein  44.93 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.623939  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>