More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5602 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5602  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 487 aa  986    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2908  Aldehyde Dehydrogenase  73.31 
 
 		 487 aa  721    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.491333  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5026  Betaine-aldehyde dehydrogenase  80.08 
 
 		 487 aa  798    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1545  Aldehyde Dehydrogenase  74.33 
 
 		 487 aa  734    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678495  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5673  aldehyde dehydrogenase  79.2 
 
 		 476 aa  783    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4971  aldehyde dehydrogenase  70.02 
 
 		 487 aa  655    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0773  betaine-aldehyde dehydrogenase  57.35 
 
 		 518 aa  551  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.781579  normal  0.7194 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1492  aldehyde dehydrogenase  57.99 
 
 		 492 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3077  aldehyde dehydrogenase  55.56 
 
 		 500 aa  536  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364593  normal  0.0549958 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6594  aldehyde dehydrogenase  57.53 
 
 		 492 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.596939 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2938  aldehyde dehydrogenase  56.15 
 
 		 490 aa  512  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0055  betaine-aldehyde dehydrogenase  57.4 
 
 		 498 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.103268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  40.44 
 
 		 490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  40.28 
 
 		 497 aa  347  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.3 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  39.34 
 
 		 506 aa  344  2e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.09 
 
 		 488 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  41.09 
 
 		 488 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.09 
 
 		 488 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  39.25 
 
 		 490 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.99 
 
 		 496 aa  339  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.57 
 
 		 490 aa  338  9e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  41.09 
 
 		 488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  40.67 
 
 		 488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 		 488 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3102  aldehyde dehydrogenase  41.29 
 
 		 502 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  39.63 
 
 		 499 aa  335  9e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 		 487 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  40.2 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  41.07 
 
 		 495 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.45 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.32 
 
 		 495 aa  330  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.11 
 
 		 494 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  39.45 
 
 		 494 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.45 
 
 		 494 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  38.9 
 
 		 494 aa  329  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  39.45 
 
 		 494 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  39.45 
 
 		 494 aa  329  6e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  39.45 
 
 		 494 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.24 
 
 		 494 aa  329  9e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.05 
 
 		 498 aa  328  9e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1942  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  41.78 
 
 		 495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2325  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  41.59 
 
 		 495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0945  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.88 
 
 		 497 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.587312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1822  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  41.14 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2065  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  38.45 
 
 		 498 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  38.72 
 
 		 494 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  39.82 
 
 		 492 aa  324  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  40.29 
 
 		 510 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  40.49 
 
 		 499 aa  324  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4669  Aldehyde Dehydrogenase  40.7 
 
 		 497 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395716  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  38.89 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1510  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  40.91 
 
 		 495 aa  323  4e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01277  gamma-Glu-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase, NAD(P)H-dependent  41.27 
 
 		 495 aa  323  6e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 		 494 aa  323  6e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2346  Aldehyde Dehydrogenase  41.27 
 
 		 495 aa  323  6e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952724  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01288  hypothetical protein  41.27 
 
 		 495 aa  323  6e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1415  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  41.27 
 
 		 495 aa  323  6e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0937  aldehyde dehydrogenase  37.73 
 
 		 499 aa  322  7e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370684  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1536  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  41.27 
 
 		 495 aa  322  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.17 
 
 		 508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.29 
 
 		 500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1527  transposase, IS605 OrfB family  40.53 
 
 		 421 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  37.32 
 
 		 497 aa  320  5e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  36.89 
 
 		 494 aa  320  5e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3527  aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 		 495 aa  319  6e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000694209  normal  0.0931426 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.87 
 
 		 492 aa  319  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0734  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.53 
 
 		 528 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2026  aldehyde dehydrogenase family protein  41.53 
 
 		 496 aa  319  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0642  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.53 
 
 		 496 aa  319  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.39 
 
 		 492 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 		 500 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  37.84 
 
 		 495 aa  317  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  37.89 
 
 		 490 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  39.26 
 
 		 524 aa  317  4e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0967  aldehyde dehydrogenase  38.73 
 
 		 498 aa  317  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.593803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3021  aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 		 498 aa  317  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3105  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.08 
 
 		 498 aa  317  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2648  aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 		 498 aa  316  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.868356  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09034  aldehyde dehydrogenase ALDH (AFU_orthologue; AFUA_8G02310)  39.8 
 
 		 511 aa  316  7e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.699324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1942  aldehyde dehydrogenase family protein  40.97 
 
 		 496 aa  316  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  39.48 
 
 		 494 aa  316  7e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.88 
 
 		 500 aa  316  8e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.88 
 
 		 500 aa  316  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.88 
 
 		 500 aa  316  8e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  37.87 
 
 		 489 aa  316  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.97 
 
 		 496 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1187  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.57 
 
 		 509 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2913  aldehyde dehydrogenase  40.29 
 
 		 506 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.701952  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5278  aldehyde dehydrogenase family protein  39.67 
 
 		 497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1807  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  41.36 
 
 		 468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  38.73 
 
 		 494 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  38.46 
 
 		 473 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  37.66 
 
 		 489 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.13 
 
 		 491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5330  aldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 		 497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  42.02 
 
 		 495 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 		 500 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5188  aldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 		 526 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.536573  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.65 
 
 		 494 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>