35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5248 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5248  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 353 aa  739    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal  0.61528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.38 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.95 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3785  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.56 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5372  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.49 
 
 		 352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18295 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1653  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.38 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1043  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.61 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000546658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1330  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.2 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0969  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.4 
 
 		 377 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1007  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.4 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0973  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.53 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0801  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.55 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.940089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1059  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.76 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000220  hypothetical protein  27 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3519  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.05 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.546474  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05956  hypothetical protein  26.04 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1148  hypothetical protein  25.4 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.18 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1331  hypothetical protein  24.84 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1020  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.05 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0690  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.27 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0327295  normal  0.622853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3781  hypothetical protein  25.07 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1308  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.52 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.59 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.823594  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.77 
 
 		 402 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3245  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.72 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2966  hypothetical protein  24.86 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.5 
 
 		 947 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3704  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.91 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.36 
 
 		 790 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.53 
 
 		 788 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  21.1 
 
 		 788 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  20.39 
 
 		 788 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>