More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4782 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  100 
 
 		 530 aa  1079    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2726  transposase IS66  60.93 
 
 		 516 aa  620  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0344579  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6199  transposase IS66  65.87 
 
 		 549 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.07824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  47.72 
 
 		 529 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  47.36 
 
 		 537 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  47.18 
 
 		 510 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  45.29 
 
 		 505 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  45.29 
 
 		 505 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  45.29 
 
 		 505 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  45.11 
 
 		 527 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  43.47 
 
 		 539 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  41.3 
 
 		 553 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  41.3 
 
 		 553 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  43.44 
 
 		 514 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  41.98 
 
 		 523 aa  363  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  42.18 
 
 		 523 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  42.18 
 
 		 523 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  42.18 
 
 		 523 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  42.18 
 
 		 523 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  42.18 
 
 		 523 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  42.18 
 
 		 523 aa  361  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  39.93 
 
 		 531 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  41.27 
 
 		 513 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  41.27 
 
 		 523 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  41.27 
 
 		 523 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  41.27 
 
 		 523 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  41.27 
 
 		 523 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  41.27 
 
 		 523 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  41.27 
 
 		 523 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  41.27 
 
 		 523 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  41.27 
 
 		 523 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  41.27 
 
 		 523 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  40.86 
 
 		 523 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  40.12 
 
 		 520 aa  349  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  40.12 
 
 		 520 aa  349  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  40.87 
 
 		 508 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  41 
 
 		 520 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  39.17 
 
 		 516 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  40.56 
 
 		 532 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  37.76 
 
 		 524 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  37.76 
 
 		 524 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2744  transposase IS66  37.76 
 
 		 524 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  37.9 
 
 		 556 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0556  IS66 family orf3  39.55 
 
 		 523 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.433641  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6364  transposase IS66  38.46 
 
 		 524 aa  318  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0522  IS66 family element, orf3  39.34 
 
 		 523 aa  316  5e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  39.47 
 
 		 491 aa  316  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3983  transposase IS66  40.22 
 
 		 461 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  37.92 
 
 		 537 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  36.03 
 
 		 533 aa  310  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  37.17 
 
 		 553 aa  309  8e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  36.97 
 
 		 549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  38.02 
 
 		 524 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  36.86 
 
 		 531 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  36.21 
 
 		 517 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  34.66 
 
 		 545 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  36.62 
 
 		 537 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  296  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  296  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  296  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  33.82 
 
 		 545 aa  296  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  33.82 
 
 		 545 aa  296  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  296  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  33.82 
 
 		 545 aa  296  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  35.85 
 
 		 512 aa  296  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  33.82 
 
 		 545 aa  296  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3593  transposase IS66  41.53 
 
 		 404 aa  296  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.324594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  36.64 
 
 		 540 aa  296  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  36.64 
 
 		 540 aa  296  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  36.45 
 
 		 540 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  35.66 
 
 		 512 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  35.96 
 
 		 527 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  35.96 
 
 		 527 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>