More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0713 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1038  cysteinyl-tRNA synthetase  79.05 
 
 		 463 aa  714    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0713  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 466 aa  961    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1184  cysteinyl-tRNA synthetase  77.75 
 
 		 463 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.257527  normal  0.696826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0965  cysteinyl-tRNA synthetase  63.56 
 
 		 506 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.910557  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  63.02 
 
 		 482 aa  600  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1228  cysteinyl-tRNA synthetase  62.42 
 
 		 477 aa  585  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  67.9 
 
 		 588 aa  579  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  58.9 
 
 		 463 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680985  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  60.13 
 
 		 449 aa  521  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2208  cysteinyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 		 491 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3374  cysteinyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 		 493 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301866  normal  0.0269367 
 
 
-
 
NC_004310  BR0677  cysteinyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 506 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0670  cysteinyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 506 aa  501  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2611  cysteinyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 505 aa  500  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.536822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3498  cysteinyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 472 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0481  cysteinyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 500 aa  483  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2086  cysteinyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 488 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.634388  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 458 aa  471  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 458 aa  458  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5285  cysteinyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 		 462 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.693404  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5212  cysteinyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 462 aa  458  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.253411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5571  cysteinyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0459  cysteinyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 460 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0171748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4745  cysteinyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1638  cysteinyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 460 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2661  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 499 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 462 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 486 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2071  cysteinyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 486 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1958  cysteinyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.773483 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 474 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4063  cysteinyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 459 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 474 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 472 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 485 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 494 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 481 aa  364  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 463 aa  362  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 458 aa  360  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 466 aa  360  4e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 468 aa  360  4e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 465 aa  359  6e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 488 aa  358  8e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 465 aa  358  8e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 466 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0635  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 457 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 470 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 493 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 454 aa  356  5e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 480 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 456 aa  356  5.999999999999999e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 465 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 493 aa  354  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 468 aa  353  5e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 490 aa  352  5.9999999999999994e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 479 aa  352  7e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 488 aa  351  1e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 505 aa  351  1e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 460 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 459 aa  351  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 462 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 461 aa  349  7e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2159  cysteinyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 465 aa  348  8e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1656  cysteinyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 465 aa  348  8e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000728192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3156  cysteinyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 465 aa  348  8e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.719949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2681  cysteinyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 465 aa  348  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 481 aa  349  8e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 459 aa  349  8e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2596  cysteinyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 465 aa  348  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0629177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1432  cysteinyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 465 aa  348  8e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2545  cysteinyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 465 aa  348  8e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 459 aa  348  9e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 459 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 480 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 459 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 459 aa  348  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 459 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 465 aa  346  6e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 463 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 487 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2510  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390951  hitchhiker  0.00182498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>