29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6271 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6271  Heme NO binding domain protein  100 
 
 		 179 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11538  putative guanylate cyclase-related protein  43.02 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00897184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2751  heme NO binding domain-containing protein  41.11 
 
 		 182 aa  150  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25984  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2525  hypothetical protein  43.58 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1053  hypothetical protein  44.58 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2325  hypothetical protein  43.37 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2378  hypothetical protein  43.02 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1754  hypothetical protein  40.34 
 
 		 177 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.213928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3098  Guanylate cyclase-related protein  40.22 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0133241  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1013  putative heme binding protein  38.2 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003158  guanylate cyclase-related protein  40.34 
 
 		 179 aa  135  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01911  hypothetical protein  36.07 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1532  4-vinyl reductase, 4VR  36.69 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2746  heme NO binding domain-containing protein  39.24 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4860  Heme NO binding domain protein  40 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0981088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4397  heme NO binding domain-containing protein  40.61 
 
 		 181 aa  121  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0582827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3804  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  37.29 
 
 		 180 aa  117  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00493  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  35.19 
 
 		 179 aa  107  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202903  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5547  Heme NO binding domain protein  36.26 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3609  hypothetical protein  32.94 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0659  hypothetical protein  34.71 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1373  Heme NO binding domain protein  33.97 
 
 		 182 aa  92.8  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2144  hypothetical protein  27.65 
 
 		 181 aa  91.7  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3557  hypothetical protein  31.25 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.2 
 
 		 604 aa  57.4  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.72 
 
 		 604 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.57 
 
 		 597 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  24.69 
 
 		 701 aa  44.3  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0387298 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.25 
 
 		 605 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00337409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>