22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5423 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5423  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  283  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3341  protein of unknown function DUF1486  65.65 
 
 		 134 aa  193  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  50 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  52.71 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  50.38 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  52.85 
 
 		 131 aa  141  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  52.8 
 
 		 133 aa  141  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  52.42 
 
 		 141 aa  138  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  51.24 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  48.82 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  48.82 
 
 		 133 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  54.24 
 
 		 136 aa  133  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  48.03 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  49.18 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  49.59 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  47.24 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  48.03 
 
 		 132 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  48.03 
 
 		 132 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  41.73 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  28 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2071  hypothetical protein  29.57 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  23.89 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>