45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3781 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3781  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656806  normal  0.14797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2751  hypothetical protein  63.01 
 
 		 167 aa  262  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2533  hypothetical protein  40.39 
 
 		 239 aa  175  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3617  hypothetical protein  41.71 
 
 		 215 aa  157  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  38.57 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2344  hypothetical protein  38.12 
 
 		 225 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0735  hypothetical protein  42.27 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5549  hypothetical protein  33.82 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  34.47 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  38.76 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  38 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  34.08 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4243  hypothetical protein  34.76 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1737  hypothetical protein  35.53 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2349  hypothetical protein  35.53 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391911  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0930  hypothetical protein  38.34 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572615  normal  0.581042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2370  hypothetical protein  35.53 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0953  hypothetical protein  36.6 
 
 		 289 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195854  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2385  hypothetical protein  35.57 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0740  hypothetical protein  35.59 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  32.11 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5317  hypothetical protein  35.33 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5688  hypothetical protein  35.57 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4440  hypothetical protein  35.78 
 
 		 245 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2267  hypothetical protein  34.02 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1316  hypothetical protein  38.25 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1950  hypothetical protein  38.25 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.530616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1165  hypothetical protein  38.25 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1156  hypothetical protein  38.25 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0287  hypothetical protein  38.25 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615178  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1003  hypothetical protein  38.25 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0861  hypothetical protein  38.25 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1214  hypothetical protein  31.84 
 
 		 233 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.835454 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  34.27 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3331  hypothetical protein  32.82 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55019 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  36.76 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5126  hypothetical protein  28.77 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  normal  0.929155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0888  hypothetical protein  29.03 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2439  hypothetical protein  38.32 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.872565  hitchhiker  0.00642281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0783  hypothetical protein  37.29 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  33.51 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  27.84 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34085  predicted protein  23.18 
 
 		 512 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05620  hypothetical protein  25.45 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06030  hypothetical protein  28.38 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>