88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0463 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0463  Redoxin domain protein  100 
 
 
367 aa  757    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3993  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.53 
 
 
378 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2877  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.2 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5749  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.39 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.566272  normal  0.459715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1834  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.15 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3991  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.63 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1448  thioredoxin family protein  28.14 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00492149  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13208  thiol:disulfide interchange protein  21.81 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.281994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2523  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.434668  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3383  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.88 
 
 
164 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2010  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.2 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2878  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.14 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2082  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.66 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2011  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.37 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4115  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.72 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106933  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3992  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.984971  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2112  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.48 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278161  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0452  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.9 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0250158  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6429  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.32 
 
 
715 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0633633  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1638  thioredoxin family protein  23.66 
 
 
328 aa  64.7  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4777  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.11 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1793  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1078  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.16 
 
 
383 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.899255  hitchhiker  0.00036256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7187  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.5 
 
 
375 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2276  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.53 
 
 
342 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.54286  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3227  redoxin family protein  38.71 
 
 
297 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5957  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.57 
 
 
378 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131947  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1833  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.21 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  28.95 
 
 
433 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  31.62 
 
 
173 aa  60.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  32.85 
 
 
164 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.61 
 
 
288 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1961  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.16 
 
 
371 aa  59.7  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5143  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.79 
 
 
284 aa  59.7  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000973211  hitchhiker  0.00708488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.04 
 
 
455 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.86 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3108  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.2 
 
 
393 aa  56.2  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.370556  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5727  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.57 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2106  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.46 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  29.31 
 
 
167 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  24.03 
 
 
173 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  25.32 
 
 
173 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  24.83 
 
 
173 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  24.03 
 
 
173 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  24.03 
 
 
173 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  24.03 
 
 
173 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  25.16 
 
 
173 aa  53.1  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  25.5 
 
 
173 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  26.09 
 
 
173 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1249  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.15 
 
 
331 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  24.68 
 
 
173 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.245531  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  28.17 
 
 
168 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  28.18 
 
 
165 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.1 
 
 
171 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.61 
 
 
171 aa  49.7  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  27.82 
 
 
447 aa  49.7  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0908  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.75 
 
 
405 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000924853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4526  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.98 
 
 
377 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75  normal  0.0257072 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  24.83 
 
 
173 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3793  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.66 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2080  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.95 
 
 
199 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.57 
 
 
184 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0802  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.2 
 
 
164 aa  47.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.35 
 
 
175 aa  46.6  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.08 
 
 
193 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  25.45 
 
 
173 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  34.85 
 
 
191 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  34.85 
 
 
191 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  25.55 
 
 
165 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  29.81 
 
 
191 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  34.85 
 
 
191 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  34.85 
 
 
191 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  34.85 
 
 
191 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  26.14 
 
 
174 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  36.36 
 
 
191 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0134  thiol-disulfide isomerase  25.36 
 
 
474 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00111234  normal  0.144049 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.16 
 
 
169 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1226  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24 
 
 
679 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18591  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1367  thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  26.42 
 
 
185 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.150367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1427  anti-oxidant AhpCTSA family protein  26.42 
 
 
185 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  25.9 
 
 
174 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.89 
 
 
173 aa  43.5  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0977  Peroxiredoxin  28.57 
 
 
149 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0905227  normal  0.0347076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  36.92 
 
 
183 aa  43.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  33.85 
 
 
164 aa  42.7  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  34.85 
 
 
191 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.16 
 
 
169 aa  42.7  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.56 
 
 
158 aa  42.7  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370052  normal  0.134943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>