More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0449 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0449  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 425 aa  880    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0964102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3203  S-adenosylmethionine synthetase  84.98 
 
 		 426 aa  724    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1489  S-adenosylmethionine synthetase  75.35 
 
 		 416 aa  634    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3691  S-adenosylmethionine synthetase  77.46 
 
 		 417 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.191471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4094  S-adenosylmethionine synthetase  74.41 
 
 		 416 aa  625  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.682465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3400  S-adenosylmethionine synthetase  74.13 
 
 		 419 aa  620  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.456148 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0271  S-adenosylmethionine synthetase  71.46 
 
 		 417 aa  603  1.0000000000000001e-171  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05975  putative S-adenosylmethionine synthetase  71.6 
 
 		 417 aa  595  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1896  S-adenosylmethionine synthetase  66.06 
 
 		 429 aa  592  1e-168  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.359449 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0922  S-adenosylmethionine synthetase  56.35 
 
 		 404 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0672  S-adenosylmethionine synthetase  57.21 
 
 		 404 aa  444  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.017434  hitchhiker  0.00762172 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0808  S-adenosylmethionine synthetase  56.51 
 
 		 405 aa  442  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1641  S-adenosylmethionine synthetase  56.61 
 
 		 404 aa  444  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2688  S-adenosylmethionine synthetase  56.74 
 
 		 388 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  52.22 
 
 		 395 aa  441  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1640  S-adenosylmethionine synthetase  55.48 
 
 		 405 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.269895 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  52.91 
 
 		 395 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  52.91 
 
 		 395 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  52.13 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1547  S-adenosylmethionine synthetase  56.28 
 
 		 404 aa  431  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  54.26 
 
 		 403 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2094  S-adenosylmethionine synthetase  56.74 
 
 		 404 aa  432  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387431  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  52.13 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  51.9 
 
 		 399 aa  431  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  51.88 
 
 		 396 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0385  S-adenosylmethionine synthetase  52.59 
 
 		 406 aa  428  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  52.48 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  52.48 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  52.72 
 
 		 384 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  52.48 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  52.48 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  50.7 
 
 		 403 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  52.48 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  52.48 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  52.48 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  52.48 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  51.77 
 
 		 384 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  51.77 
 
 		 384 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  51.77 
 
 		 384 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  51.77 
 
 		 384 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  49.65 
 
 		 396 aa  425  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  51.77 
 
 		 384 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  53.59 
 
 		 396 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1771  S-adenosylmethionine synthetase  51.67 
 
 		 403 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  49.88 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  50.47 
 
 		 395 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  51.77 
 
 		 384 aa  420  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 		 399 aa  418  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  55.04 
 
 		 397 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  50.71 
 
 		 387 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  49.53 
 
 		 399 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  50.35 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  49.77 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  49.77 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  49.77 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  49.07 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  49.77 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  49.53 
 
 		 399 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  50.23 
 
 		 399 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  52.24 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1840  S-adenosylmethionine synthetase  51.2 
 
 		 403 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  49.77 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  53.98 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  52.28 
 
 		 382 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  51.2 
 
 		 383 aa  411  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  50.35 
 
 		 384 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  55.47 
 
 		 383 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  51.77 
 
 		 384 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  51.54 
 
 		 383 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  51.89 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  51.54 
 
 		 383 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  51.65 
 
 		 383 aa  413  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  53.51 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  48.58 
 
 		 395 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  51.54 
 
 		 383 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04686  S-adenosylmethionine synthetase  51.71 
 
 		 403 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  51.77 
 
 		 384 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  52.37 
 
 		 391 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  52.37 
 
 		 391 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  51.67 
 
 		 383 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  52.12 
 
 		 383 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  52.12 
 
 		 383 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  50.35 
 
 		 396 aa  413  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  51.66 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  50.83 
 
 		 384 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  52.12 
 
 		 383 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  51.77 
 
 		 384 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  52 
 
 		 395 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  50.59 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  48.22 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5269  S-adenosylmethionine synthetase  50.35 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.613554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  51.54 
 
 		 383 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0454  S-adenosylmethionine synthetase  51.06 
 
 		 396 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  51.42 
 
 		 396 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  49.53 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  50.83 
 
 		 383 aa  408  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1470  S-adenosylmethionine synthetase  51.75 
 
 		 412 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 		 383 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>