35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3149 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3149  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0873  hypothetical protein  96.97 
 
 		 132 aa  258  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  96.21 
 
 		 132 aa  256  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3682  hypothetical protein  93.18 
 
 		 132 aa  248  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1029  hypothetical protein  88.98 
 
 		 127 aa  235  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.674916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1041  hypothetical protein  88.98 
 
 		 127 aa  235  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3331  hypothetical protein  88.19 
 
 		 127 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1008  hypothetical protein  88.19 
 
 		 127 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2981  hypothetical protein  87.4 
 
 		 127 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2854  hypothetical protein  66.93 
 
 		 127 aa  188  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  63.33 
 
 		 125 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  59.84 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  57.38 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  53.97 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  53.97 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1336  hypothetical protein  46.51 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0256  hypothetical protein  33.6 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 285 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  30.77 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  31.86 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  35.64 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  30 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  32.04 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  30.28 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1240  hypothetical protein  29.09 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.370362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2439  hypothetical protein  31.9 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1957  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0991042  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0232  hypothetical protein  28.3 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.190765  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  29.7 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  27.78 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  27.78 
 
 		 120 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  42.86 
 
 		 743 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  27.78 
 
 		 120 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  29.63 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  26.72 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>