51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0267 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  53.25 
 
 		 669 aa  734    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  53.12 
 
 		 668 aa  724    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  64.02 
 
 		 662 aa  912    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  52 
 
 		 668 aa  709    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  95.2 
 
 		 667 aa  1310    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  64.62 
 
 		 662 aa  912    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  53.55 
 
 		 668 aa  743    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  98.2 
 
 		 667 aa  1348    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  100 
 
 		 667 aa  1368    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  52.31 
 
 		 674 aa  685    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  48.96 
 
 		 669 aa  666    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  52.68 
 
 		 668 aa  717    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  47.85 
 
 		 672 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  37.71 
 
 		 699 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  36.72 
 
 		 703 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  37.45 
 
 		 693 aa  411  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  38.53 
 
 		 669 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  35.37 
 
 		 699 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  36.57 
 
 		 695 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  36.91 
 
 		 672 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  36.04 
 
 		 697 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  36.43 
 
 		 695 aa  405  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  36.43 
 
 		 695 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  35 
 
 		 695 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  35.14 
 
 		 695 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  35.14 
 
 		 695 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  35.14 
 
 		 695 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  35.99 
 
 		 698 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  34.05 
 
 		 695 aa  388  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  35.4 
 
 		 704 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  31.67 
 
 		 706 aa  318  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  30.14 
 
 		 716 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  30.24 
 
 		 716 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  29.5 
 
 		 712 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  29.65 
 
 		 712 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  30.24 
 
 		 716 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  29.36 
 
 		 712 aa  306  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  30 
 
 		 716 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  29.36 
 
 		 712 aa  302  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  30.78 
 
 		 703 aa  282  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  28.82 
 
 		 711 aa  279  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  28.08 
 
 		 656 aa  240  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  26.46 
 
 		 698 aa  234  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  27.79 
 
 		 573 aa  188  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  27.87 
 
 		 565 aa  176  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  25.69 
 
 		 660 aa  158  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  25.17 
 
 		 706 aa  115  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  23.62 
 
 		 681 aa  106  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  21.55 
 
 		 807 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  19.41 
 
 		 835 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  20.15 
 
 		 772 aa  52.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>