83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3261 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3261  thiopurine S-methyltransferase  100 
 
 
218 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154958  hitchhiker  0.00386199 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4010  thiopurine S-methyltransferase  65.33 
 
 
226 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000530597  unclonable  0.000000000128309 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0588  thiopurine S-methyltransferase  64.68 
 
 
219 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00909445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3784  thiopurine S-methyltransferase  62.84 
 
 
218 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3727  thiopurine S-methyltransferase  62.84 
 
 
218 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4153  thiopurine S-methyltransferase  65.32 
 
 
223 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0453346  normal  0.132491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0541  thiopurine S-methyltransferase  62.39 
 
 
218 aa  300  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3449  thiopurine S-methyltransferase  62.84 
 
 
218 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0580  thiopurine S-methyltransferase  63.76 
 
 
218 aa  300  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.947193  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0581  thiopurine S-methyltransferase  61.93 
 
 
218 aa  296  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.904773 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3910  thiopurine S-methyltransferase  61.47 
 
 
218 aa  294  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0582  thiopurine S-methyltransferase  64.22 
 
 
218 aa  287  7e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3498  thiopurine S-methyltransferase  59.17 
 
 
219 aa  287  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3296  thiopurine S-methyltransferase  63.76 
 
 
218 aa  287  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0541  thiopurine S-methyltransferase  59.63 
 
 
218 aa  276  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0543  thiopurine S-methyltransferase  56.42 
 
 
218 aa  258  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0425379  hitchhiker  0.00996251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2323  thiopurine S-methyltransferase  51.38 
 
 
218 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27460  thiopurine S-methyltransferase  49.31 
 
 
218 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00890318  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2525  thiopurine S-methyltransferase  47.25 
 
 
219 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186445  normal  0.445106 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3845  thiopurine S-methyltransferase  47 
 
 
216 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0510882  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1870  thiopurine S-methyltransferase  45.62 
 
 
216 aa  197  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.629149  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1479  thiopurine S-methyltransferase  46.05 
 
 
215 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.193618  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3985  thiopurine S-methyltransferase  45.12 
 
 
217 aa  191  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1445  thiopurine S-methyltransferase  43.78 
 
 
216 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0413435  normal  0.359474 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15380  Thiopurine S-methyltransferase  44.5 
 
 
218 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2259  thiopurine S-methyltransferase  42.2 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.498891  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1777  thiopurine s-methyltransferase  41.74 
 
 
220 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3617  thiopurine S-methyltransferase  41.28 
 
 
220 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003701  thiopurine S-methyltransferase  43.33 
 
 
226 aa  167  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.994639  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0794  thiopurine S-methyltransferase  41.4 
 
 
222 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000172804  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02114  thiopurine S-methyltransferase  41.9 
 
 
216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3055  thiopurine S-methyltransferase  39.09 
 
 
219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1758  thiopurine S-methyltransferase  40.28 
 
 
211 aa  159  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3096  thiopurine S-methyltransferase family protein  44.67 
 
 
212 aa  158  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0849  thiopurine S-methyltransferase  45.14 
 
 
218 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000750886  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2244  thiopurine S-methyltransferase  36.11 
 
 
219 aa  152  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1814  thiopurine S-methyltransferase  40.19 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0216423  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2332  thiopurine S-methyltransferase  39.91 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742383  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3438  thiopurine S-methyltransferase  35.16 
 
 
213 aa  141  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2726  thiopurine S-methyltransferase  41.52 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2892  thiopurine S-methyltransferase  39.38 
 
 
221 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02272  thiopurine S-methyltransferase family protein  39.33 
 
 
217 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2747  thiopurine S-methyltransferase  38.86 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0288  thiopurine S-methyltransferase  37.67 
 
 
230 aa  134  7.000000000000001e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1365  thiopurine S-methyltransferase  35.21 
 
 
215 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233426 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0514  thiopurine S-methyltransferase  44.65 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2473  Thiopurine S-methyltransferase  34.55 
 
 
217 aa  129  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.465624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1524  thiopurine S-methyltransferase  34.8 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1333  thiopurine S-methyltransferase  30.9 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2144  Thiopurine S-methyltransferase  38.14 
 
 
214 aa  111  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00106923  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0515  thiopurine S-methyltransferase  36.02 
 
 
219 aa  111  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.766215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6497  Thiopurine S-methyltransferase  34.68 
 
 
228 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0320896  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3057  thiopurine S-methyltransferase  32.58 
 
 
216 aa  98.2  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05270  conserved hypothetical protein  28.02 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  27.57 
 
 
213 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6055  thiopurine S-methyltransferase  29.02 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  25.27 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  27.46 
 
 
201 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4046  hypothetical protein  25.51 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.877488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0653  thiopurine S-methyltransferase  28.12 
 
 
207 aa  52  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.696799  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2081  thiopurine S-methyltransferase  26.56 
 
 
201 aa  52  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  0.891479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0462  hypothetical protein  27.89 
 
 
209 aa  51.6  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0337  thiopurine S-methyltransferase  25 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3675  thiopurine S-methyltransferase  23.7 
 
 
201 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0352  thiopurine S-methyltransferase  23.91 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.675368 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2755  thiopurine S-methyltransferase  27.46 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0701437  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2116  thiopurine S-methyltransferase  27.46 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2728  thiopurine S-methyltransferase  27.46 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0571  thiopurine S-methyltransferase  25.27 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06094  thiol methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13570)  28.21 
 
 
283 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0045541 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2779  thiopurine S-methyltransferase  26.42 
 
 
208 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000397  SAM-dependent methyltransferase  23.16 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1335  thiopurine S-methyltransferase  30.71 
 
 
202 aa  46.2  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0124  thiol methyltransferase 1-like  22.22 
 
 
199 aa  45.1  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0557  thiopurine S-methyltransferase family protein  27.59 
 
 
245 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30453  predicted protein  26.67 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2403  thiopurine S-methyltransferase family protein  26.9 
 
 
261 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0190  thiopurine S-methyltransferase family protein  26.9 
 
 
261 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2323  thiopurine S-methyltransferase family protein  26.9 
 
 
256 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2755  thiopurine S-methyltransferase family protein  26.9 
 
 
256 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.712624  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0849  thiopurine S-methyltransferase family protein  26.9 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0988064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0688  putative thiopurine S-methyltransferase  26.9 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0672  putative thiopurine S-methyltransferase  26.9 
 
 
267 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>