41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3735 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3861  polysulphide reductase NrfD  97.5 
 
 		 360 aa  701    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.773503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3678  Polysulphide reductase NrfD  98.33 
 
 		 360 aa  706    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3735  polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 360 aa  716    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0663  polysulphide reductase, NrfD  96.67 
 
 		 360 aa  697    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0590  polysulphide reductase NrfD  97.78 
 
 		 360 aa  703    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0634  polysulphide reductase, NrfD  85.71 
 
 		 364 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00082842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0634  polysulphide reductase, NrfD  84.4 
 
 		 364 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  35.8 
 
 		 361 aa  176  8e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1068  polysulphide reductase NrfD  40.34 
 
 		 352 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177902 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003033  tetrathionate reductase subunit C  36.39 
 
 		 376 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0898  tetrathionate reductase, subunit C  35.13 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.392425  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1518  tetrathionate reductase complex subunit C  34.45 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000105218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1787  tetrathionate reductase complex, subunit C  34.45 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1481  tetrathionate reductase complex subunit C  34.45 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.393478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1424  Polysulphide reductase NrfD  35.6 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270293  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1958  tetrathionate reductase complex, subunit C  34.17 
 
 		 340 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  hitchhiker  0.000000744183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1497  tetrathionate reductase complex, subunit C  34.17 
 
 		 340 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000345555 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2423  polysulphide reductase, NrfD  35.87 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00497953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4245  polysulphide reductase NrfD  34.13 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370954  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  26.65 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  28.11 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2141  Polysulphide reductase NrfD  30.41 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0724041  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  25.47 
 
 		 348 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0618  formate-dependent nitrite reductase membrane component-like  26.07 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0787087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  25.79 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  26.34 
 
 		 330 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  28.8 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  28.96 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  27.92 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  27.36 
 
 		 314 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  25.79 
 
 		 305 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  26.63 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2402  Polysulphide reductase NrfD  28.38 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000296698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  26.34 
 
 		 304 aa  46.2  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  24.79 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3442  polysulphide reductase, NrfD  28 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2001  polysulphide reductase, NrfD  27.1 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  22.83 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  26.25 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  24.79 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0916  Polysulphide reductase NrfD  22.13 
 
 		 394 aa  42.7  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.451801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>