40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3534 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3534  transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 249 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3459  transcriptional regulator, CadC  98.39 
 
 		 249 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0833  transcriptional regulator, CadC  98.39 
 
 		 249 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3653  transcriptional regulator, CadC  96.79 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.409424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3240  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  65.59 
 
 		 247 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0783  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  65.59 
 
 		 247 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3343  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  65.59 
 
 		 247 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0940  transcriptional regulator-related protein  62.75 
 
 		 247 aa  332  4e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0880  transcriptional regulator, CadC  64.78 
 
 		 247 aa  330  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.102623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3632  response regulator receiver protein  46.59 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3438  winged helix family two component response transcriptional regulator  46.59 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0883  response regulator receiver protein  42.91 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2749  putative transcriptional regulator, CadC  46.22 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0760  response regulator receiver protein  41.39 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0885  transcriptional regulator, CadC  45.2 
 
 		 246 aa  190  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0653  hypothetical protein  26.59 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0881  putative transcriptional regulator, CadC  25.98 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0879  hypothetical protein  26.85 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3347  transcriptional regulator  25.3 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.730311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0936  transcriptional regulator  24.22 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0793  putative transcriptional regulator, CadC  23.89 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.790637  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3244  response regulator receiver protein  22.8 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0779  response regulator receiver protein  22.8 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0757  putative transcriptional regulator, CadC  38.14 
 
 		 151 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.19634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3465  DNA-binding winged-HTH domain-containing protein  30.54 
 
 		 435 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.817886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1255  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.81 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2225  two component transcriptional regulator  33.67 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4023  invasion protein regulator  33.33 
 
 		 565 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.876946 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 493 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 493 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 493 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3588  two component transcriptional regulator  43.66 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  34.09 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  34.09 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0089  response regulator receiver protein  31.33 
 
 		 171 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  34.52 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  31.07 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  34.94 
 
 		 244 aa  42  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 223 aa  42  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>