156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2947 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  90.65 
 
 		 834 bp  1009    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  90.65 
 
 		 834 bp  1009    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  90.65 
 
 		 834 bp  1009    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2947    100 
 
 		 1052 bp  2085    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  100 
 
 		 834 bp  1653    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0277  transposase IS3/IS911 family protein  94.92 
 
 		 312 bp  280  8e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0739  transposase IS3/IS911 family protein  94.92 
 
 		 312 bp  280  8e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3842  transposase IS3/IS911 family protein  94.92 
 
 		 312 bp  280  8e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3083  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 126 bp  250  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3970  transposase IS3/IS911 family protein  92.42 
 
 		 306 bp  91.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3958  transposase IS3/IS911 family protein  91.67 
 
 		 306 bp  79.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.98909  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3981  transposase IS3/IS911 family protein  91.67 
 
 		 306 bp  79.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403658  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4090  transposase IS3/IS911 family protein  91.67 
 
 		 306 bp  79.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0406  transposase IS3/IS911 family protein  91.67 
 
 		 306 bp  79.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0647  transposase IS3/IS911 family protein  91.67 
 
 		 306 bp  79.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1000  transposase IS3/IS911 family protein  91.67 
 
 		 306 bp  79.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0881    87.5 
 
 		 1169 bp  71.9  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01676  hypothetical protein  90 
 
 		 312 bp  71.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2598  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1561  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0068  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00561335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4755  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3109  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3019  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1594  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0718  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.373976  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0303  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00845112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0696  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0129  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2605  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2734  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0225  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1637  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1768  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1695  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00957844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1667  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4925  IS911, transposase orfA  87.88 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  89.47 
 
 		 783 bp  65.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  89.47 
 
 		 783 bp  65.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  89.47 
 
 		 783 bp  65.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  90.38 
 
 		 810 bp  63.9  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2833  transposase and inactivated derivatives  93.18 
 
 		 828 bp  63.9  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0562  transposase  89.29 
 
 		 837 bp  63.9  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  88.33 
 
 		 303 bp  63.9  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1147    94.87 
 
 		 774 bp  61.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2964    94.87 
 
 		 774 bp  61.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.458335  normal  0.0428962 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  91.49 
 
 		 309 bp  61.9  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2585  putative transposase  91.49 
 
 		 243 bp  61.9  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2274  IS911, transposase orfA  86.36 
 
 		 303 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2161  IS911, transposase orfA  86.36 
 
 		 303 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.03565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2980    86.36 
 
 		 523 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0192958  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1361  IS911, transposase orfA  86.36 
 
 		 303 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2307  IS911, transposase orfA  86.36 
 
 		 303 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4079  IS911, transposase orfA  86.36 
 
 		 303 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1020  IS911, transposase orfA  86.36 
 
 		 303 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  86.36 
 
 		 303 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3299  IS911, transposase orfA  86.36 
 
 		 303 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  86.36 
 
 		 303 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  86.36 
 
 		 303 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1687  IS911, transposase orfA  86.36 
 
 		 303 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1921  IS911, transposase orfA  86.36 
 
 		 303 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4640  IS911, transposase orfA  86.36 
 
 		 303 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4618  IS911, transposase orfA  86.36 
 
 		 303 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.55073  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0090  IS911, transposase orfA  86.36 
 
 		 303 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0561  transposase  92.86 
 
 		 312 bp  60  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0365  integrase catalytic subunit  86.15 
 
 		 909 bp  58  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0594  integrase catalytic subunit  86.15 
 
 		 852 bp  58  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1140  integrase catalytic subunit  86.15 
 
 		 852 bp  58  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1571  integrase catalytic subunit  86.15 
 
 		 852 bp  58  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3491  integrase catalytic subunit  86.15 
 
 		 852 bp  58  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  91.11 
 
 		 906 bp  58  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0417    88.46 
 
 		 809 bp  56  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  83.75 
 
 		 819 bp  56  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0651  helix-turn-helix, Fis-type  90.7 
 
 		 300 bp  54  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0987  helix-turn-helix, Fis-type  90.7 
 
 		 300 bp  54  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4607  helix-turn-helix, Fis-type  90.7 
 
 		 300 bp  54  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2983    88.24 
 
 		 615 bp  54  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  89.36 
 
 		 813 bp  54  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  89.36 
 
 		 813 bp  54  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  89.36 
 
 		 813 bp  54  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  89.36 
 
 		 813 bp  54  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  89.36 
 
 		 813 bp  54  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  89.36 
 
 		 813 bp  54  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  89.36 
 
 		 813 bp  54  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  89.36 
 
 		 813 bp  54  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  89.36 
 
 		 813 bp  54  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0441  transposase OrfAB, subunit A  89.36 
 
 		 345 bp  54  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0731  transposase OrfAB, subunit A  89.36 
 
 		 345 bp  54  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0739  transposase OrfAB, subunit A  89.36 
 
 		 345 bp  54  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1387  transposase OrfAB, subunit A  89.36 
 
 		 345 bp  54  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2360  transposase OrfAB, subunit A  89.36 
 
 		 345 bp  54  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4415  transposase IS3/IS911 family protein  89.36 
 
 		 312 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  86.44 
 
 		 813 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  86.44 
 
 		 813 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2336  transposase IS3/IS911 family protein  89.36 
 
 		 312 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0514936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3016  transposase IS3/IS911 family protein  90.48 
 
 		 312 bp  52  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3144  transposase IS3/IS911 family protein  90.48 
 
 		 312 bp  52  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0609516  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4038  transposase IS3/IS911 family protein  90.48 
 
 		 312 bp  52  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>