46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1767 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  247  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  98.33 
 
 
120 aa  244  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  98.33 
 
 
120 aa  244  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  97.5 
 
 
120 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2331  hypothetical protein  70.83 
 
 
125 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1630  hypothetical protein  65.83 
 
 
127 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634363  normal  0.124961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1563  hypothetical protein  65 
 
 
127 aa  170  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1638  hypothetical protein  65 
 
 
127 aa  168  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0416797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2890  hypothetical protein  65 
 
 
126 aa  167  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  54.17 
 
 
127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  49.17 
 
 
121 aa  135  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  53.33 
 
 
124 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1957  hypothetical protein  42.5 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0991042  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  30.51 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  25 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  30 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  27.5 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 
285 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0372  hypothetical protein  29.81 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0110151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  27.03 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2630  hypothetical protein  21.19 
 
 
122 aa  47  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.640654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  26.72 
 
 
124 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0839  hypothetical protein  24.58 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1011  hypothetical protein  25.21 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116392  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  24.07 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0759  hypothetical protein  25.21 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1485  hypothetical protein  27.52 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  26.61 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1248  hypothetical protein  17.8 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0238294  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1323  hypothetical protein  24.37 
 
 
120 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804067  normal  0.155599 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1509  hypothetical protein  26.61 
 
 
114 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.322803  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  26.96 
 
 
125 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1487  hypothetical protein  26.61 
 
 
114 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4166  hypothetical protein  22.02 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.25145  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  29.73 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  30.43 
 
 
125 aa  42.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  28.7 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3682  hypothetical protein  27.52 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2958  hypothetical protein  31.65 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  0.292777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0873  hypothetical protein  27.78 
 
 
132 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3149  hypothetical protein  29.63 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2981  hypothetical protein  26.36 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3852  hypothetical protein  25 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0472  hypothetical protein  25 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.088779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3796  hypothetical protein  25 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110754  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3978  hypothetical protein  25 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>