More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26130 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_26130  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0005  tRNA-Met  96 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.208114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0083  tRNA-Met  96 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0007  tRNA-Met  94.67 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0026  tRNA-Met  94.67 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  6.52648e-26  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0014  tRNA-Met  94.67 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0042  tRNA-Met  94.67 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.324618  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0086  tRNA-Met  94.67 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0019  tRNA-Met  94.67 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0324694  normal  0.0212218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0024  tRNA-Met  94.67 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0898053 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt019  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00289748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0048  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00409102  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0014  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000138583  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0746  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2792  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000935283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2795  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000169803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2478  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00948036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2481  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000303707  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0006  tRNA-Met  94.29 
 
 		 73 bp  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0013  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0557998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0012  tRNA-Met  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000664581  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0074  tRNA-Met  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0141721  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tMet03  tRNA-Met  95.24 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0043  tRNA-Met  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0023  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.247152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0069  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0030  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0014  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0035  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575749  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0057  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0068  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna34  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775098  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0046  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.363544  normal  0.0435272 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0016  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69639  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0016  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0676778  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  92.11 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  92.11 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  92.11 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  92.11 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0026  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0368817  normal  0.25242 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  92.11 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0066  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0931764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0027  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0686525  normal  0.260083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0052  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0858392  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0039  tRNA-Met  92.96 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0089  tRNA-Met  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014219  hitchhiker  0.00718403 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0229  tRNA-Met  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0489  tRNA-Met  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.107964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0228  tRNA-Met  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.883109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0042  tRNA-Met  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00068414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0093  tRNA-Met  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0094  tRNA-Met  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0095  tRNA-Met  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0096  tRNA-Met  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0097  tRNA-Met  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0041  tRNA-Met  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000116747 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0038  tRNA-Met  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000191641  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0033  tRNA-Met  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0058  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0037  tRNA-Met  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000756856  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0093  tRNA-Met  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.482828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1185  hypothetical protein  92.42 
 
 		 1431 bp  91.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0033  tRNA-Met  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t35  tRNA-Met  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0031  tRNA-Met  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0033  tRNA-Met  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0053  tRNA-Met  92.86 
 
 		 72 bp  91.7  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0026  tRNA-Met  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0419796  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0005  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13960  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0061  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0058  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407746  normal  0.446811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>