More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_R0066 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_R0066  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0931764  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0031  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0043  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.399945  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0069  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0030  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0023  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.216301  normal  0.182837 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0049  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0512381 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0036  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.119632  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0112  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000290991  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0063  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00364456  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0104  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000123497  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0073  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000821998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0121  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000952956  decreased coverage  0.0000866797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0084  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0249486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0097  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000407558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0017  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0082  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t017  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000231655  unclonable  0.00000000000340211 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t058  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0442009  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0034  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0131764 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00057  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0096  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0019  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.69794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5667  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5675  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000376256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5699  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000350684  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t022  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.51 
 
 		 80 bp  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0182265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.51 
 
 		 80 bp  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00436106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.51 
 
 		 80 bp  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.51 
 
 		 80 bp  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0383767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.51 
 
 		 80 bp  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000267735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-8  tRNA-Met  93.51 
 
 		 80 bp  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3215  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0042  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238456  normal  0.634383 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3216  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.527253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000768608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3467  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139541  normal  0.865403 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3661  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.677335  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2792  tRNA-Met  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000935283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2795  tRNA-Met  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000169803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2478  tRNA-Met  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00948036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2481  tRNA-Met  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000303707  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet01  tRNA-Met  93.51 
 
 		 80 bp  113  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0040  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251493  hitchhiker  0.0001025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0041  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000296842  normal  0.054295 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2957  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0013  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0082  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0688432  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0081  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0699076  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0039  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00627079  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0080  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0693639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0020  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2955  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.14009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0021  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0019  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0052  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00733518  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4213  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.355481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4214  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4212  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3184  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4696  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4693  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0014  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4276  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5065  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5071  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0026  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116452  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5066  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.126908  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5064  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0081  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0120643  normal  0.12492 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0013  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0557998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0088  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0282515  hitchhiker  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4700  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00322718  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0005  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3990  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0171  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761498  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2747  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177551  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2750  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.88112e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2751  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.74519e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3227  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0186102  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3226  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0172509  normal  0.439997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0094  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>