More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19590 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19590  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  100 
 
 		 337 aa  694    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.197301  hitchhiker  0.00100295 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1075  methionine import ATP-binding protein MetN  49.06 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0967  ABC transporter ATP-binding protein  50.32 
 
 		 322 aa  298  1e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0358  ABC transporter related protein  49.69 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.703642  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1233  methionine import ATP-binding protein MetN  45.96 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0644  ABC transporter, ATP-binding protein  44.65 
 
 		 318 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1250  methionine import ATP-binding protein MetN  46.23 
 
 		 318 aa  281  8.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0534  ABC transporter related protein  44.24 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1540  ABC transporter related  45.34 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00159208  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0865  ABC transporter, ATP-binding protein  44.48 
 
 		 336 aa  269  5e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0795  ABC transporter, ATP-binding protein  44.48 
 
 		 336 aa  268  8e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.771589  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1238  ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 336 aa  265  5.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  55.9 
 
 		 344 aa  249  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.03 
 
 		 385 aa  248  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.46 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  40.76 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.41 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.08 
 
 		 344 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.08 
 
 		 344 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.4 
 
 		 344 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.08 
 
 		 344 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.08 
 
 		 344 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.08 
 
 		 344 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.08 
 
 		 344 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.08 
 
 		 344 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.08 
 
 		 344 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.69 
 
 		 385 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.08 
 
 		 344 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.69 
 
 		 385 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.81 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.44 
 
 		 344 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  44.06 
 
 		 340 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.13 
 
 		 344 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.09 
 
 		 343 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.44 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.09 
 
 		 343 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.09 
 
 		 343 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.09 
 
 		 343 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  51.09 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  51.09 
 
 		 343 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.09 
 
 		 343 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.09 
 
 		 343 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.09 
 
 		 343 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.09 
 
 		 343 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.9 
 
 		 345 aa  236  4e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.09 
 
 		 343 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  51.09 
 
 		 343 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.09 
 
 		 343 aa  236  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.09 
 
 		 343 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.48 
 
 		 344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  51.97 
 
 		 344 aa  235  8e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.09 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0097  ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0160  ABC transporter related  42.09 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.07 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  41.64 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.22 
 
 		 343 aa  233  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  42.39 
 
 		 354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1797  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.49 
 
 		 341 aa  232  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.81 
 
 		 344 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.55 
 
 		 343 aa  231  9e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.34 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  50.66 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  50.66 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  50.66 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1547  ABC transporter ATP-binding protein  41.49 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2742  ABC transporter related  41.49 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  50 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2661  ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  50 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  50 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1796  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.06 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  52.34 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  52.34 
 
 		 391 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  40.99 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  41.32 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0166  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.766032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  47.6 
 
 		 342 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.09 
 
 		 344 aa  229  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  52.34 
 
 		 391 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0496  ABC transporter related  38.12 
 
 		 342 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000100343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0483  ABC transporter related  38.12 
 
 		 342 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000112326  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2336  ABC transporter-like  49.79 
 
 		 266 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5127  ABC transporter, ATP-binding protein  40.82 
 
 		 346 aa  229  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  43.8 
 
 		 342 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.54 
 
 		 349 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.25 
 
 		 331 aa  228  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.15 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.88 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  47.2 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  41.14 
 
 		 385 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  47.6 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  48.03 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.32 
 
 		 343 aa  227  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0421  ABC transporter related  42.03 
 
 		 341 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  44 
 
 		 369 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>