More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19320 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_19320  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  100 
 
 
140 aa  288  1e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000424338 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0437  ferric uptake regulator family protein  30.15 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04330  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  31.43 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  27.69 
 
 
152 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  28.91 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  31.82 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  31.78 
 
 
131 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 
167 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  26.52 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  33.59 
 
 
143 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  30.94 
 
 
155 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  28.68 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  30 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0940  ferric uptake regulator, Fur family  25.38 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  27.86 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1429  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 
143 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533787  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  35.45 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  31.3 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  29.55 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  32.06 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1392  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  27.91 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  30.37 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  29.23 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  29.01 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  30.22 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  28.79 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  29.85 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  28.79 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  28.06 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  28.79 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2867  ferric uptake regulator, Fur family  34.35 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000960204  decreased coverage  0.0000000000000181287 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  28.79 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  28.79 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  28.79 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  31.82 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  27.27 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  28.68 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  26.72 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  29.23 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
142 aa  53.9  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 
141 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  26.52 
 
 
139 aa  53.9  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  28.91 
 
 
146 aa  53.9  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  27.69 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  31.3 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  25.76 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  26.62 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  28.12 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  28.12 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  28.12 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  35.16 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  28.91 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  28.12 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  28.12 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  30.53 
 
 
143 aa  52.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  27.61 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  29.01 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  25.76 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  28.12 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  37.59 
 
 
131 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  27.91 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0754  ferric uptake regulator family protein  29.32 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.354602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  28.24 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  28.12 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  28.12 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5530  ferric uptake regulator family protein  27.27 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  27.7 
 
 
148 aa  52  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0931  ferric uptake regulator family protein  32.26 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  30.15 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  30.91 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  31.82 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  28.47 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  30.6 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  29.5 
 
 
157 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  27.91 
 
 
150 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  27.48 
 
 
150 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1409  ferric uptake regulator family protein  30.83 
 
 
136 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000310643  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  29.5 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  28.8 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  28.24 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>