More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12000 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12000  tellurium resistance membrane protein TerC  100 
 
 		 300 aa  598  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000641872  normal  0.194106 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1736  Integral membrane protein TerC  59.6 
 
 		 369 aa  348  6e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.146696  normal  0.0106788 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06210  tellurium resistance membrane protein TerC  60.75 
 
 		 278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.230704  hitchhiker  0.00150346 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  40.59 
 
 		 252 aa  185  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  38.35 
 
 		 250 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  38.35 
 
 		 250 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  38.35 
 
 		 250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0656  Integral membrane protein TerC  40.15 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0892415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  38.35 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  39.44 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  40.93 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  44.49 
 
 		 246 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  38.58 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  42.4 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  36.68 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  43.6 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  39.76 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  40.87 
 
 		 253 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3194  integral membrane protein TerC  40.48 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  40.56 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1664  hypothetical protein  39.06 
 
 		 247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.898463  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2157  Integral membrane protein TerC  38.97 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  41.83 
 
 		 248 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_004310  BR1721  hypothetical protein  38.67 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  39.54 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  42.52 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  37.36 
 
 		 252 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  35.88 
 
 		 249 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  38.71 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0242  integral membrane protein TerC  42.41 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0423547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  36.15 
 
 		 251 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  38.87 
 
 		 238 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  40 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  34.85 
 
 		 523 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  36.86 
 
 		 249 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0537  integral membrane protein TerC  41.7 
 
 		 259 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  37.5 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  38.89 
 
 		 510 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  38.18 
 
 		 259 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  41.13 
 
 		 251 aa  165  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  36.96 
 
 		 523 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  39.46 
 
 		 522 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2691  membrane protein, TerC family  39.17 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607869  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  39.76 
 
 		 522 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  39.62 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  37.93 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  38.8 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  36.96 
 
 		 523 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  36.36 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  39.2 
 
 		 527 aa  163  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5520  integral membrane protein TerC  36.36 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350667  normal  0.0618236 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  36.76 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  35.09 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  35.97 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  39.78 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1231  Integral membrane protein TerC  33.92 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  40.16 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  43.08 
 
 		 253 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  43.08 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  37.94 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  36.58 
 
 		 523 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  42.69 
 
 		 253 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1196  integral membrane protein TerC  38.67 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  37.13 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  37.5 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  38.69 
 
 		 295 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  34.71 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  34.25 
 
 		 529 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  35.71 
 
 		 251 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  35.71 
 
 		 251 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  38.15 
 
 		 518 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3716  Integral membrane protein TerC  36.9 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4355  Integral membrane protein TerC  39.15 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47040  TerC family protein  39.15 
 
 		 515 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53321  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  38.46 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  39.76 
 
 		 237 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  39.76 
 
 		 237 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  39.76 
 
 		 237 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  39.76 
 
 		 237 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  39.76 
 
 		 237 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  39.76 
 
 		 237 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  39.76 
 
 		 237 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  38.17 
 
 		 529 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  39.76 
 
 		 237 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  39.76 
 
 		 237 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  37.34 
 
 		 577 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4672  integral membrane protein TerC  38.68 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0807  hypothetical protein  35.71 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6503  Integral membrane protein TerC  35.69 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2752  TerC family membrane protein  37.19 
 
 		 251 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1135  TerC family membrane protein  37.19 
 
 		 251 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560446  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2908  inner membrane protein  37.19 
 
 		 251 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241578  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  38.87 
 
 		 518 aa  155  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  37.34 
 
 		 528 aa  155  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1760  hypothetical protein  38.15 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  41.2 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  35.57 
 
 		 519 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  35.57 
 
 		 519 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  35.57 
 
 		 519 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4056  hypothetical protein  38.76 
 
 		 515 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>