More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0993 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
339 aa  675    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.51 
 
 
338 aa  478  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  72 
 
 
338 aa  475  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.84 
 
 
337 aa  475  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.15 
 
 
337 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.56 
 
 
338 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.64 
 
 
338 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.87 
 
 
342 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.98 
 
 
338 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.88 
 
 
363 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.75 
 
 
334 aa  454  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.36 
 
 
354 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.77 
 
 
345 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.63 
 
 
341 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.05 
 
 
344 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.06 
 
 
355 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.44 
 
 
334 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.14 
 
 
334 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.44 
 
 
334 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.85 
 
 
351 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.62 
 
 
334 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.46 
 
 
358 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.62 
 
 
334 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.45 
 
 
345 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.62 
 
 
334 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.54 
 
 
334 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.62 
 
 
334 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.77 
 
 
355 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.96 
 
 
356 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.05 
 
 
352 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.77 
 
 
356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.77 
 
 
341 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.77 
 
 
356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.44 
 
 
350 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.76 
 
 
347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.77 
 
 
356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.77 
 
 
356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.77 
 
 
356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.16 
 
 
353 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.94 
 
 
350 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.18 
 
 
354 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.96 
 
 
356 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.77 
 
 
356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.07 
 
 
355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.96 
 
 
356 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.77 
 
 
356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.77 
 
 
356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.13 
 
 
343 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.09 
 
 
348 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.36 
 
 
357 aa  443  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.8 
 
 
337 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.77 
 
 
357 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.38 
 
 
348 aa  444  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.46 
 
 
353 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.98 
 
 
356 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.68 
 
 
336 aa  443  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.09 
 
 
348 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.77 
 
 
357 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  63 
 
 
336 aa  442  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.24 
 
 
337 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.05 
 
 
348 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.43 
 
 
338 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.33 
 
 
334 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.77 
 
 
348 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.83 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.24 
 
 
352 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.8 
 
 
334 aa  437  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.72 
 
 
336 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.33 
 
 
334 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.94 
 
 
338 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.24 
 
 
352 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.61 
 
 
334 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.88 
 
 
335 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.33 
 
 
334 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.33 
 
 
334 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.65 
 
 
330 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.83 
 
 
352 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.63 
 
 
356 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.48 
 
 
335 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.05 
 
 
363 aa  437  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  62.61 
 
 
355 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.46 
 
 
354 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.11 
 
 
336 aa  435  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.8 
 
 
336 aa  434  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.3 
 
 
334 aa  435  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  63 
 
 
337 aa  435  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.24 
 
 
355 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.05 
 
 
343 aa  434  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.35 
 
 
343 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.02 
 
 
344 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.83 
 
 
337 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.3 
 
 
335 aa  434  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.31 
 
 
334 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.5 
 
 
336 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.42 
 
 
355 aa  431  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.03 
 
 
333 aa  431  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.88 
 
 
361 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.8 
 
 
354 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.03 
 
 
338 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.33 
 
 
333 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>