42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0960 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0960  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  510  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.417092  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  29.28 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  29.28 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  28.83 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  28.83 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  28.83 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  28.83 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  28.83 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  28.83 
 
 
234 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  28.83 
 
 
234 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  27.93 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  27.68 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  30.6 
 
 
249 aa  55.5  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  33.58 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  27.27 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  28.89 
 
 
253 aa  52  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  28.89 
 
 
253 aa  52  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  28.25 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  31.11 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  28.15 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  30.53 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  32.58 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  25.4 
 
 
293 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.85 
 
 
278 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3638  YdjC family protein  29.63 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.962606  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1523  YdjC family protein  26.12 
 
 
266 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  29.5 
 
 
289 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  26.55 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  27.74 
 
 
292 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  26.23 
 
 
280 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5902  YdjC family protein  28.36 
 
 
288 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  27.07 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  24.34 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  24.34 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  26.79 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  24.34 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  24.34 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25.64 
 
 
283 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.1 
 
 
294 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  25.74 
 
 
249 aa  42.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  24.34 
 
 
252 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2756  hypothetical protein  26.56 
 
 
291 aa  42  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.905596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>