39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_4039 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  714    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  78.99 
 
 		 356 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  78.99 
 
 		 356 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  78.65 
 
 		 356 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  71.19 
 
 		 354 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  72.07 
 
 		 357 aa  530  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  61.77 
 
 		 362 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  61.54 
 
 		 361 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  59.83 
 
 		 361 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  54.97 
 
 		 363 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  54.42 
 
 		 363 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  53.04 
 
 		 370 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  53.07 
 
 		 375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  51.55 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  50 
 
 		 364 aa  357  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  49.3 
 
 		 362 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  49.18 
 
 		 426 aa  348  6e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  48.19 
 
 		 374 aa  344  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  47.78 
 
 		 363 aa  344  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  50.42 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  49.13 
 
 		 356 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  46.18 
 
 		 365 aa  333  3e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  46.15 
 
 		 351 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  44.76 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  40.38 
 
 		 378 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  42.7 
 
 		 281 aa  232  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  39.54 
 
 		 347 aa  212  7e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  39.4 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  39.88 
 
 		 382 aa  202  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  35 
 
 		 395 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  41.05 
 
 		 245 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  33.1 
 
 		 387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  31.27 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  61.84 
 
 		 85 aa  93.2  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  39.84 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  37.5 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  30.17 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  25.26 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2571  protein of unknown function DUF450  24.72 
 
 		 268 aa  49.7  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>