51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3685 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  67.26 
 
 		 669 aa  983    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  56.76 
 
 		 668 aa  830    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  53.29 
 
 		 662 aa  743    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  64.48 
 
 		 668 aa  929    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  48.66 
 
 		 667 aa  658    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  53.29 
 
 		 662 aa  741    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  67.51 
 
 		 668 aa  984    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  48.66 
 
 		 667 aa  663    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  48.96 
 
 		 667 aa  666    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  52.68 
 
 		 674 aa  749    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  51.47 
 
 		 672 aa  721    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  100 
 
 		 669 aa  1373    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  56.17 
 
 		 668 aa  823    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  38.2 
 
 		 699 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  36.9 
 
 		 703 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  37.18 
 
 		 695 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  37.18 
 
 		 695 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  38.3 
 
 		 698 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  37.18 
 
 		 695 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  37.32 
 
 		 695 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  37.11 
 
 		 699 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  37.78 
 
 		 697 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  38.18 
 
 		 695 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  37.7 
 
 		 695 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  38.03 
 
 		 695 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  37.45 
 
 		 693 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  38.03 
 
 		 695 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  36.28 
 
 		 669 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  36.83 
 
 		 672 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  37.66 
 
 		 704 aa  415  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  30.7 
 
 		 712 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  30.81 
 
 		 712 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  30.23 
 
 		 712 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  29.65 
 
 		 712 aa  297  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  29.24 
 
 		 706 aa  298  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  29.35 
 
 		 716 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  28.93 
 
 		 716 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  29.21 
 
 		 716 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  28.93 
 
 		 716 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  29.62 
 
 		 711 aa  287  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  28.99 
 
 		 703 aa  279  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  30.01 
 
 		 656 aa  264  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  30.16 
 
 		 565 aa  226  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  25.93 
 
 		 698 aa  217  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  29.69 
 
 		 573 aa  211  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  24.24 
 
 		 660 aa  145  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  23.12 
 
 		 681 aa  126  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  23.99 
 
 		 706 aa  96.3  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  20.7 
 
 		 772 aa  84.3  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  21.05 
 
 		 835 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  19.43 
 
 		 807 aa  62  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>